爷爷奶奶和孙女在同一房产证上做了份额约定，该约定是具有法律效力的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律效力的基础
物权法原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，物权是权利人依法对特定的物享有直接支配和排他的权利。房产作为不动产，其物权归属和份额可以通过约定来确定。
- 爷爷奶奶和孙女作为房产的共有人，有权通过协议约定各自在房产中的份额。这种约定一旦形成，即对各方具有法律约束力。
合同自由原则：
- 在民事法律关系中，合同自由是一项基本原则。只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，就是有效的。
- 爷爷奶奶和孙女之间的份额约定，可以视为一种合同行为。只要该约定是双方真实意思的表示，且没有违反上述规定，就是有效的。
二、份额约定的具体形式与效力
书面形式：
- 为了确保份额约定的明确性和可证明性，建议采用书面形式进行约定。书面合同可以详细记录各方的权利和义务，避免未来可能出现的纠纷。
- 如果已经以书面形式进行了份额约定，并且该约定符合法律要求，那么该约定就是有效的，对各方具有法律约束力。
登记公示：
- 虽然份额约定本身具有法律效力，但为了更好地保护各方的权益，建议将份额约定进行登记公示。通过登记公示，可以明确房产的共有情况和各方的份额，避免未来可能出现的产权纠纷。
- 如果房产已经登记了共有情况和份额，那么该登记信息就是具有法律效力的证明文件。
三、可能存在的法律风险与防范
约定不明确的风险：
- 如果份额约定不明确或者存在歧义，可能会导致未来出现纠纷。因此，在约定份额时，应该尽可能明确、具体地描述各方的份额和权利义务。
- 为了防范这种风险，建议在约定份额时咨询专业律师，确保约定内容的明确性和合法性。
未经其他共有人同意的风险：
- 如果房产存在其他共有人（如父母、兄弟姐妹等），而爷爷奶奶和孙女的份额约定未经其他共有人同意，可能会引发纠纷。
- 为了防范这种风险，在约定份额前应该与其他共有人进行充分沟通，确保各方对份额约定没有异议。
四、实际案例与法律适用
- 在实际生活中，类似爷爷奶奶和孙女在同一房产证上做份额约定的情况并不少见。只要该约定符合法律要求，就是有效的。
- 如果未来出现纠纷，法院会根据相关法律法规和合同约定来判决各方权益。因此，在约定份额时，应该充分考虑法律因素和未来可能出现的纠纷情况。
建议：为了确保份额约定的有效性和合法性，建议在约定前咨询专业律师。律师可以根据您的具体情况和需求，为您提供专业的法律建议和帮助。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。