结论：仲裁离职后，是否还有义务配合原单位纪检部门调查，需根据具体情况判断，一般而言，若调查内容与离职员工在职期间的行为相关且不违反法律法规，员工有义务配合；若调查内容与离职员工无关或违反法律法规，则员工无义务配合。

分析说明：

1. 配合调查的义务来源：

   • 劳动合同及规章制度：在职期间，员工通常需遵守公司的规章制度，包括配合内部调查。然而，离职后，这一义务的直接来源（劳动合同）已终止。但若规章制度或劳动合同中有明确规定离职后仍需配合特定调查，且该规定不违反法律法规，员工可能仍需遵守。
   • 法律法规：若调查涉及违法犯罪行为，如贪污、受贿等，根据《刑事诉讼法》等相关法律法规，任何公民都有义务配合司法机关的调查。这种情况下，即使员工已离职，也有义务配合。

2. 配合调查的义务范围：

   • 与离职员工相关的调查：如果调查内容直接涉及离职员工在职期间的行为，且该行为可能违反公司规章制度或法律法规，员工有义务配合调查，以澄清事实或承担相应责任。
   • 与离职员工无关的调查：如果调查内容与离职员工无关，员工则无义务配合。例如，调查其他在职员工的违规行为，而离职员工并不知情或未参与。

3. 不配合调查的可能后果：

   • 违反规章制度：如果离职员工拒绝配合调查，且该调查内容与其在职期间的行为相关，且规章制度中有明确规定，员工可能面临违反规章制度的后果，如被追究违约责任或影响未来就业等。但需注意，这种后果的追究需在法律法规允许的范围内。
   • 妨碍司法公正：如果调查涉及违法犯罪行为，且离职员工拒绝配合，可能构成妨碍司法公正，面临法律制裁。

特殊场景：

• 调查内容违法：如果原单位纪检部门的调查内容违反法律法规，如侵犯员工隐私、非法搜查等，员工不仅无义务配合，还有权拒绝并可能向相关部门举报。
• 调查程序不合法：即使调查内容合法，但如果调查程序不合法，如未出示合法证件、未说明调查理由等，员工也有权拒绝配合。

行动建议：

• 了解调查内容：在接到原单位纪检部门的调查通知时，首先了解调查的具体内容、目的和程序。
• 评估自身义务：根据调查内容、自身在职期间的行为以及相关法律法规和规章制度，评估自己是否有义务配合调查。
• 寻求法律帮助：如果对调查有疑问或认为调查内容、程序不合法，可以寻求专业律师的法律帮助，以维护自己的合法权益。

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