公司扣发一个月工资长达近三年的行为明显违法，您有权要求公司立即补发工资并可能主张其他赔偿，具体分析如下：

1. 公司行为违法性分析
   根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《工资支付暂行规定》第七条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或无故拖欠。公司扣发工资的行为已持续近三年，远超合理期限（如因核算争议等短期暂扣），且未提供合法依据（如您存在严重失职造成损失等），构成违法克扣工资。

2. 您的核心权利与救济途径

   • 要求补发工资：您可向公司书面提出补发要求，明确扣发时间、金额及法律依据（如《劳动法》第五十条），并保留送达证据（如邮件、短信记录）。
     
   • 投诉举报：若公司拒绝，可向当地劳动监察大队投诉（需提供劳动合同、工资条、扣发证明等材料），监察部门可责令公司限期支付并加付赔偿金（按应付金额50%-100%标准）。
     
   • 申请仲裁：直接向劳动争议仲裁委员会提起仲裁，主张补发工资及经济补偿（如因拖欠工资被迫离职的，可主张N个月工资的经济补偿金，N为工作年限）。
     
   • 诉讼途径：对仲裁结果不服的，可在15日内向法院起诉，通过司法程序强制执行。

3. 关键证据收集建议

   • 劳动关系证明：劳动合同、工作证、考勤记录等。
     
   • 工资扣发证据：工资条、银行流水（显示未发放该月工资）、公司通知或内部文件（如有）。
     
   • 沟通记录：与公司协商的邮件、聊天记录、录音等，证明您曾主张权利。
     
   • 时效问题说明：劳动争议仲裁时效为1年，但若您能证明曾向公司主张权利或公司承诺补发（如邮件、录音），时效可能中断并重新计算。您的情况虽接近3年，但若存在时效中断情形，仍可主张权利。

4. 风险提示与策略建议

   • 公司可能抗辩理由：如主张您造成损失需赔偿，但公司需举证损失金额及因果关系，且赔偿金额不得超过月工资的20%（《工资支付暂行规定》第十六条）。若公司无法提供充分证据，抗辩不成立。
     
   • 协商优先：可先尝试与公司协商，明确告知其违法性及您的诉求，避免矛盾激化。若公司态度强硬，再启动法律程序。
     
   • 集体维权：若多名员工遭遇同类问题，可联合维权，降低个体维权成本。

行动建议：立即整理证据，向公司发出书面补发通知；若未果，7日内向劳动监察大队投诉或直接申请仲裁。如有疑问，可进一步向我提供具体细节（如扣发原因、公司态度等），我会为您制定更精准的维权方案。