离职了公司扣三天工资，您可以按照以下步骤处理：
一、明确扣款原因与合法性
首先，您需要了解公司扣除您三天工资的具体原因。如果是因为您旷工、未按规定程序辞职或其他违反公司规定的行为导致的扣款，您需要查看劳动合同和公司规章制度，确认这些规定是否合法以及是否明确规定了扣款事项。
如果劳动合同或公司规章制度中并未明确规定相关扣款事项，或者规定本身不合法（如扣款金额超出法定限制），那么公司的扣款行为可能构成违法。
二、与公司协商
如果确认公司的扣款行为存在不合法或不合理之处，您可以首先尝试与公司进行协商。在协商过程中，您可以明确指出公司的扣款行为违反了相关法律法规或劳动合同约定，并要求公司足额支付您的工资。
协商时，建议您保留好与公司的聊天记录、通话录音等证据，以便后续维权使用。
三、向劳动监察部门投诉
如果与公司协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对公司进行调查，并责令其改正违法行为。如果公司逾期不支付克扣的工资，还需要加付赔偿金。
在投诉时，您需要准备好劳动合同、工资条、考勤记录等能证明劳动关系和工资数额的证据材料。
四、申请劳动仲裁
如果劳动监察部门的处理结果仍然无法让您满意，或者公司拒绝履行劳动监察部门的决定，您可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
在申请仲裁时，您需要按照法定程序提交仲裁申请书和相关证据材料。仲裁委员会将依法进行审理，并作出仲裁裁决。如果您对仲裁结果不服，还可以在规定时间内向人民法院提起诉讼。
五、注意事项
及时采取措施：一旦发现公司存在克扣工资的行为，您应及时采取措施进行维权，避免拖延导致证据丢失或维权难度增加。
保留证据：在维权过程中，您需要保留好所有与劳动关系和工资情况相关的证据材料，以便后续使用。
了解法律法规：在维权前，建议您了解相关法律法规和劳动政策，以便更好地维护自己的合法权益。
总之，面对公司克扣工资的行为，您应依法维权，通过协商、投诉、仲裁等合法途径维护自己的工资权益。