多个行政违法行为能否在一起处罚，结论是可以的，但需遵循一定的原则和规则。以下是对此问题的详细分析：
一、处罚原则
分别认定原则：
- 行政机关应对每一个违法行为进行独立调查，根据其性质、情节以及社会危害程度等因素，依法作出认定。这是确保处罚公正性和合理性的基础。
合并执行原则：
- 在分别认定的基础上，对于多个违法行为，行政机关可以决定合并执行处罚。但合并执行需遵循特定规则，如“一事不再罚”原则，即对同一个违法行为不得给予两次以上的行政处罚，特别是罚款处罚。但对于多个不同的行政违法行为，即使它们发生在同一事件或同一时间段内，也不受此限制。
二、合并执行的具体规则
有牵连关系的多个违法行为：
- 若多个违法行为之间存在手段与目的、原因与结果等牵连关系，实践中一般择一重处，即选择较重的违法行为来确定处罚幅度。
无牵连关系的多个违法行为：
- 若多个行政违法行为之间相互独立，不存在牵连关系，则分别对每个违法行为进行处罚，并根据具体情况决定是合并执行还是分别执行。例如，对于罚款等财产性处罚，通常将多个违法行为的罚款金额相加，作为最终的罚款数额。
三、特殊规定与注意事项
行政拘留合并执行的上限：
- 根据《中华人民共和国治安管理处罚法》，行政拘留处罚合并执行的最长期限不得超过二十日。这是对行政拘留合并执行的一种特殊限制。
多人共同违法或复杂事件的处理：
- 若是多人共同违法或某一违法事件涵盖多个性质不同的违法行为，行政机关应分别对每个违法行为进行处罚，确保处罚的准确性和针对性。
合理性原则：
- 行政机关在决定并处时，需综合考虑违法行为的性质、情节、危害后果等因素，确保处罚种类和幅度适当，与违法行为的社会危害性相适应，避免过重或过轻的处罚。
四、实践意义与法律后果
- 行政处罚中的并处制度体现了对违法行为的全面和公正处理原则，有助于维护社会秩序和公共利益，同时保障了法律的严肃性和权威性。
- 若行政机关未遵循相关原则和规则进行处罚，当事人有权依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
法律建议：
- 对于行政机关而言，在处理多个行政违法行为时，应严格遵循相关法律法规和原则，确保处罚的合法性和合理性。
- 对于当事人而言，若对处罚决定不服，应及时了解自身权益和救济途径，依法申请行政复议或提起行政诉讼。
举例说明：
- 假设某企业既未按规定进行环境影响评价擅自开工，又超标排放污染物，构成两项独立违法。行政机关在分别认定后，可以决定对这两项违法行为进行合并处罚，如分别处以罚款并合并执行，但需确保罚款总额不超过法定上限，并遵循“一事不再罚”原则。
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