结论前置：老板将人员工资私自发并备注为公司借款，对员工而言，确实可能存在坏处，具体影响需根据实际情况分析。

1. 税务风险：

   • 税务合规性：工资是员工应得的劳动报酬，应依法申报并缴纳个人所得税。若老板将工资备注为公司借款，可能试图规避税务申报，导致员工面临税务风险。一旦税务部门查实，员工可能需要补缴税款、滞纳金，甚至面临罚款。
   • 建议：员工应要求老板按照实际工资发放，并确保税务申报的合规性。若老板坚持备注为公司借款，员工应保留相关证据，如工资条、转账记录等，以备不时之需。

2. 劳动关系认定：

   • 劳动关系证明：工资是证明劳动关系的重要证据之一。若工资被备注为公司借款，可能在劳动争议中影响劳动关系的认定，进而影响员工权益的维护。
   • 建议：员工应确保工资发放记录清晰、明确，避免与借款等混淆。在发生劳动争议时，及时提供工资发放记录等证据，以证明劳动关系的存在。

3. 工资支付保障：

   • 工资支付义务：根据《劳动法》等相关法律法规，用人单位有义务按时足额支付员工工资。若老板将工资备注为公司借款，可能试图逃避工资支付义务，导致员工工资得不到保障。
   • 建议：员工应要求老板按照劳动合同约定的时间和金额支付工资。若老板拖欠或拒付工资，员工可以依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

4. 法律责任风险：

   • 法律责任：若老板将工资备注为公司借款的行为被认定为违法，如偷逃税款、逃避工资支付义务等，老板可能面临法律责任，而员工也可能因涉及该行为而受到牵连。
   • 建议：员工应增强法律意识，避免参与或协助老板进行任何违法活动。若发现老板有违法行为的迹象，应及时向相关部门举报或寻求法律援助。

综合建议：老板将人员工资私自发并备注为公司借款的行为对员工而言存在诸多潜在风险。员工应增强法律意识，确保工资发放的合规性和透明性。若遇到此类情况，员工应保留相关证据，及时与老板沟通并要求纠正。若沟通无果或老板坚持违法行为，员工可以依法向相关部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。