员工手册中规定旷工三天开除，在符合一定条件下是合理的。以下是对此问题的详细分析：
一、合法性基础
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条的规定，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。因此，如果员工手册中明确规定了旷工三天属于严重违反规章制度的行为，并且该规定经过民主程序制定（如经职工代表大会或者全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定）且已向员工公示或告知，那么用人单位有权依据此规定解除劳动合同。
二、合法性的具体条件
规章制度合法有效：
- 员工手册中的规定必须内容合法、程序合法，并向劳动者公示或告知。
- 规章制度的内容不得违反法律法规的强制性规定，也不得侵犯劳动者的合法权益。例如，不能设定过于严苛或不合理的旷工天数作为开除条件，而应考虑行业惯例和员工实际情况。
旷工事实确凿：
- 用人单位必须有充分的证据证明员工存在旷工行为，如考勤记录、监控视频、同事证言等。
- 证据应当真实、合法且与旷工事实相关联。
解除程序正当：
- 在解除劳动合同前，用人单位应当进行调查核实，听取员工的申辩意见。
- 解除劳动合同的决定应当以书面形式通知员工，并说明解除的理由和依据。
无其他违法情形：
- 用人单位在解除劳动合同时，不得存在其他违法行为，如拖欠工资、未缴纳社会保险等。
三、不合法或不合理的情况
规章制度不合法或不合理：
- 若员工手册未经民主程序制定，或内容违反法律法规，或未向劳动者公示，则该规章制度不能作为辞退员工的合法依据。
- 如果旷工三天的规定过于严苛或不合理，也可能被认定为不合法。
存在误解或不可抗力：
- 如果员工旷工是由于不可抗力因素导致，或员工对旷工的认定存在误解，且公司未经调查核实就直接辞退员工，这种辞退行为很可能被认定为不合法。
解除程序不合法：
- 若公司在辞退过程中未遵循法定程序，如未书面通知员工、未说明辞退理由和依据等，则辞退行为可能构成违法解除。
四、法律后果与建议
- 若旷工三天辞退被认定为合法，公司无需支付经济补偿金，但应确保结算员工的工资。
- 若旷工三天辞退被认定为不合法，公司可能需要向员工支付赔偿金，并面临法律诉讼的风险。
- 建议：公司在制定员工手册时，务必遵循法律规定和民主程序，确保规章制度的合法性、合理性和公示性。同时，在辞退员工时，应严格按照规章制度和法定程序进行操作，以避免法律风险。员工也应了解并遵守公司的规章制度，以维护自己的职业发展和权益。
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