医药公司的业务员收取供应给药店老板的货款，这一行为是否违法，需结合具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：
业务员是否有权收取货款：
- 有权收取：如果业务员是医药公司正式授权的员工，且公司明确赋予其收取货款的权限，那么业务员收取货款是合法的。这种情况下，业务员的行为代表公司，货款应视为公司收取。
- 无权收取：如果业务员未经公司明确授权，或者公司规定货款应直接支付给公司账户而非业务员个人，那么业务员私自收取货款可能构成违法。这种行为可能涉及侵占公司财产或挪用资金，具体取决于款项的处理方式和用途。
货款的处理方式：
- 上交公司：如果业务员收取货款后及时上交公司，且公司对此知情并认可，那么这一行为通常不构成违法。
- 私自截留：如果业务员收取货款后私自截留，未上交公司，或者将货款用于个人用途，那么这一行为很可能构成违法，如侵占罪或挪用资金罪。
法律后果：
- 民事责任：如果业务员的行为给公司造成损失，公司有权要求业务员赔偿损失。
- 刑事责任：如果业务员的行为构成犯罪，如侵占罪或挪用资金罪，将面临刑事处罚，包括有期徒刑、罚金等。
法律建议：
- 对于医药公司而言，应明确业务员在货款收取方面的权限和责任，避免出现权限模糊或责任不清的情况。
- 对于药店老板而言，在支付货款时应确认收款人的身份和权限，确保货款支付给合法授权的收款人。
- 如果发现业务员有私自收取货款或截留货款的行为，应及时向公司报告，并考虑采取法律措施维护自身权益。
可能涉及的法律条款：
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，侵占罪是指以非法占有为目的，将代为保管的他人财物非法占为己有，数额较大且拒不退还的行为；挪用资金罪是指公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，挪用本单位资金归个人使用或者借贷给他人，数额较大、超过三个月未还的，或者虽未超过三个月，但数额较大、进行营利活动的，或者进行非法活动的行为。
综上所述，医药公司的业务员收取供应给药店老板的货款是否违法，需根据业务员是否有权收取、货款的处理方式以及具体法律条款来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。