关于与总公司还是分公司和甲方签协议的问题，需根据具体情况综合判断，以下是从不同角度给出的分析：
法律地位与责任承担角度
- 总公司：具有独立的法人资格，能够独立承担民事责任。与总公司签订协议，意味着明确的权益保障主体，一旦发生纠纷或协议无法履行，维权和追责的路径相对清晰。
- 分公司：通常不具有独立法人资格，其民事责任由总公司承担。与分公司签订协议时，需特别关注总公司的支持和保障力度，以防分公司无法履行协议时，维权过程可能变得复杂且耗时。
实际业务运营与管理角度
- 总公司：负责整体战略规划，可能提供更多接触核心业务和高层管理的机会。但工作流程可能相对繁琐，竞争也可能更为激烈。
- 分公司：更贴近具体业务运营，可能提供更多实际操作和快速积累实践经验的机会。管理可能更为灵活，工作氛围也可能更为轻松。但业务范围可能受限，培训和晋升资源可能不如总公司丰富。
协议执行与后续保障角度
- 总公司：通常拥有更为完善的规章制度和执行规范，能够提供更为稳定和系统的培训和职业发展规划。
- 分公司：协议的执行和后续保障可能受到总公司政策和资源分配的影响。如果分公司运营状况不佳，可能会影响到协议的履行和毕业生的权益。因此，在决定与分公司签订协议前，需充分评估分公司的运营状况和总公司的支持力度。
合同主体与业务关系角度
- 在签订协议前，应仔细阅读协议条款，明确合同主体和权利义务的承担者。如果协议涉及共同责任，需确保各方责任明确且可执行。
- 考虑业务关系时，如果业务主要与分公司相关，且分公司能够独立承担责任，那么与分公司签订协议可能是合适的选择。但如果业务涉及整个公司集团或多个分公司，或者与总公司有紧密的业务联系，那么与总公司签订协议可能更为稳妥。
风险评估与控制角度
- 在决定与总公司还是分公司签订协议前，应进行充分的风险评估。了解分公司的法律地位和履约能力，以及总公司的支持和保障力度。
- 与总公司签订协议通常能够获得更强的履约保障和风险控制能力。但如果分公司运营状况良好，且得到总公司的充分支持，那么与分公司签订协议也可能是一个不错的选择。
法律建议：
- 在决定与总公司还是分公司签订协议前，建议仔细审查合同条款，了解业务关系和法律实体情况。
- 如有必要，可以咨询我这样的专业律师，根据具体情况和业务需求提供详细准确的法律建议。
- 综合考量个人职业规划、就业保障、实践机会等因素，做出明智的决策。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。