针对您提出的“公司要毕业证扫描件可以拒绝吗”这一问题，我的答案是：在大多数情况下，您可以拒绝公司直接扣留或长期保管您毕业证原件的要求，但对于提供扫描件或复印件用于合理查验的情况，需谨慎处理并注明用途。以下是我为您详细分析的原因和建议：
一、法律法规依据
根据《劳动合同法》的明确规定，用人单位在招用劳动者时，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，也不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。这里的“其他证件”自然包括了毕业证等重要证件。因此，从法律层面讲，公司无权扣留您的毕业证原件。
二、公司要求毕业证扫描件的合理性分析
查验信息：公司可能要求您提供毕业证扫描件以查验您的学历信息，这是招聘过程中的一个常见环节。在这种情况下，您可以提供扫描件，但务必在扫描件上注明“仅供XX公司查验学历信息使用”，以防止扫描件被滥用。
长期保管：如果公司要求您将毕业证原件或扫描件长期保管在公司，这显然是不合理的。您有权拒绝这种要求，因为毕业证是您的个人财产，且包含重要个人信息，不应被他人长期保管。
三、应对建议
明确拒绝扣留原件：如果公司要求您交出毕业证原件进行长期保管，您应果断拒绝，并告知公司这是违法的。
谨慎提供扫描件：如果公司仅要求提供扫描件用于查验信息，您可以提供，但务必在扫描件上注明用途，并保留好原件。
了解公司背景：在提供任何个人信息或证件前，建议您先了解公司的背景和信誉，确保公司是合法、正规的。
及时投诉举报：如果您遇到公司违法扣留证件或要求提供不合理担保的情况，可以向当地劳动监察部门投诉举报，维护自己的合法权益。
四、其他注意事项
除了毕业证外，公司还可能以其他名义收取费用或要求提供其他担保。您应牢记，求职本身并不需要任何费用，对于将先交报名费、培训费等作为条件的招聘和入职，都要谨慎对待。
综上所述，您可以拒绝公司直接扣留或长期保管您毕业证原件的要求，但对于提供扫描件用于合理查验的情况，需谨慎处理并注明用途。在求职过程中，务必保护好自己的个人信息和证件安全。