结论：员工是否可以不提供毕业证相片存档需分情况讨论，具体如下：
若公司要求合理且合法，员工一般应配合提供
根据《劳动合同法》第八条，用人单位有权了解劳动者与劳动合同直接相关的基本情况，包括学历信息。若公司要求提供毕业证相片存档的目的是为了核实员工学历真实性、确保其符合岗位任职资格（如招聘时明确要求特定学历），且该要求未超出合理范围（例如未要求提供原件或过度收集其他无关信息），则员工通常应配合提供。
例外情形：若公司已通过其他方式（如学信网验证、入职时已提交学历证明）完成学历核实，再次要求提供相片可能缺乏必要性，员工可与公司协商说明情况。
若公司要求存在以下情形，员工有权拒绝
- 超出必要范围：公司要求提供毕业证相片的同时，还要求提供其他无关个人信息（如家庭成员信息、财产状况等），可能违反《个人信息保护法》第六条“最小必要原则”，员工可拒绝提供非必要信息。
- 存在安全风险：公司未明确告知毕业证相片的存储方式、使用目的或未采取必要保密措施（如随意公开、泄露给第三方），可能导致员工个人信息被滥用，员工有权基于《个人信息保护法》第十三条拒绝提供。
- 未签订书面协议：若公司未与员工签订书面协议明确毕业证相片的使用规则（如仅用于存档、不用于其他用途），员工可要求公司补充协议或拒绝提供。
员工拒绝后的法律后果
- 若公司要求合法合理，员工无正当理由拒绝提供，可能构成违反公司规章制度（如入职时已签署同意提供学历证明的承诺书），公司可依据《劳动合同法》第三十九条解除劳动合同（但需证明员工行为严重违反规章制度）。
- 若公司要求违法或侵犯员工权益，员工拒绝提供不构成违约，公司若以此为由解除劳动合同可能构成违法解除，员工可依据《劳动合同法》第四十八条要求继续履行合同或主张赔偿金。
建议：
- 员工可先要求公司说明提供毕业证相片的具体用途、存储方式及保密措施，评估合理性后再决定是否提供。
- 若公司要求合法但员工不愿直接提供相片，可建议公司通过学信网等官方渠道验证学历，或提供复印件并注明“仅供存档使用”。
- 若公司坚持违法要求，员工可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自身权益。
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