民事案件中，当事人自行申请做出的鉴定，法院不一定会采纳。这主要取决于鉴定程序是否合法、鉴定机构及鉴定人是否具备相应资质、鉴定材料是否真实可靠以及鉴定结论是否科学合理等多个因素。以下从不同角度进行详细分析：

1. 鉴定程序合法性

• 程序合规性：法院在审查鉴定结论时，会首先关注鉴定程序是否合法。如果当事人自行申请的鉴定程序存在瑕疵，如未按照法定程序进行取样、送检等，法院可能会因此不予采纳。
• 举例说明：假设在一起交通事故责任纠纷中，当事人自行委托了某鉴定机构对车辆损失进行鉴定，但未按照法定程序通知对方当事人到场参与鉴定过程，这可能导致鉴定程序不合法，法院在审查时可能会因此不予采纳该鉴定结论。

2. 鉴定机构及鉴定人资质

• 资质要求：鉴定机构及鉴定人必须具备相应的资质和条件，才能从事司法鉴定活动。如果当事人自行选择的鉴定机构或鉴定人不具备相应资质，其出具的鉴定结论可能不会被法院采纳。
• 举例说明：在一起医疗纠纷中，当事人自行委托了一家没有医疗事故鉴定资质的机构进行鉴定，由于该机构不具备鉴定医疗事故的资质，其出具的鉴定结论可能不会被法院认可。

3. 鉴定材料真实性

• 材料真实性：鉴定结论的可靠性很大程度上取决于鉴定材料的真实性。如果当事人提供的鉴定材料存在虚假或伪造的情况，那么基于此材料得出的鉴定结论自然不会被法院采纳。
• 举例说明：在一起产品质量纠纷中，当事人为了证明产品存在质量问题，自行提供了经过篡改的检测报告作为鉴定材料。由于该材料不真实，法院在审查时可能会因此不予采纳基于该材料得出的鉴定结论。

4. 鉴定结论科学性

• 科学性要求：鉴定结论必须基于科学的方法和原理得出，具有客观性和准确性。如果鉴定结论缺乏科学性或存在明显错误，法院可能会不予采纳。
• 举例说明：在一起环境污染纠纷中，当事人自行委托的鉴定机构出具的鉴定结论认为污染程度极低，但该结论与现场实际情况明显不符，缺乏科学性。法院在审查时可能会因此不予采纳该鉴定结论。

5. 对方当事人意见

• 对方意见：在民事诉讼中，对方当事人有权对鉴定结论提出异议。如果对方当事人能够提出充分证据证明鉴定结论存在错误或不合理之处，法院可能会因此不予采纳该鉴定结论。
• 举例说明：在一起合同纠纷中，当事人自行委托的鉴定机构出具的鉴定结论认为合同标的物存在质量问题。但对方当事人提供了相反的证据证明标的物质量符合合同约定，法院在审查时可能会因此不予采纳原鉴定结论。

法律建议

• 选择正规鉴定机构：当事人在自行申请鉴定时，应选择具备相应资质和条件的正规鉴定机构进行鉴定，以确保鉴定结论的合法性和可靠性。
• 确保鉴定程序合法：当事人应严格按照法定程序进行取样、送检等鉴定活动，确保鉴定程序的合法性和公正性。
• 提供真实鉴定材料：当事人应提供真实、可靠的鉴定材料，避免提供虚假或伪造的材料导致鉴定结论不被采纳。
• 考虑对方意见：当事人在自行申请鉴定时，应考虑对方当事人的意见和利益，尽量通过协商或调解等方式解决争议，避免因鉴定结论引发更多纠纷。

如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。