企业根据内部文件发出的警告单是否合法，需分情况讨论：

1. 内部文件合法且内容合理时

   • 若企业的内部规章制度（如员工手册、奖惩制度等）是依据《劳动合同法》第四条的规定，经过民主程序制定（如职工代表大会或全体职工讨论），并向劳动者公示或告知的，那么这些内部文件具有法律效力。
   • 在此情况下，企业依据合法且合理的内部文件对员工发出警告单，是合法的行为。这种警告单通常用于对员工轻微违规行为的提醒或纠正，不涉及对员工权益的实质性损害。

2. 内部文件违法或内容不合理时

   • 如果企业的内部规章制度未经过民主程序制定，或者未向劳动者公示、告知，那么这些文件可能不具备法律效力。
   • 此外，即使内部文件经过了合法程序制定，但如果其内容违反了法律、行政法规的强制性规定，或者存在显失公平、不合理的情况（如对员工进行不公正的处罚），那么企业依据这些文件发出的警告单也可能是不合法的。
   • 在这种情况下，员工有权对警告单提出异议，并可以通过法律途径维护自己的合法权益。

3. 警告单的内容与执行

   • 除了内部文件的合法性外，警告单的内容和执行方式也是判断其是否合法的重要因素。警告单应当明确、具体地指出员工的违规行为，并说明相应的处罚措施或改进要求。
   • 如果警告单的内容模糊不清、缺乏依据，或者执行方式不当（如滥用职权、恶意打压等），那么这种警告单也可能是不合法的。

法律建议：

• 对于企业而言，应当确保内部规章制度的合法性和合理性，并严格按照规定程序制定和执行。在发出警告单时，应当确保内容明确、具体，并遵循公平、公正的原则。
• 对于员工而言，如果收到企业发出的警告单，应当仔细审查其合法性和合理性。如果认为警告单不合法或不合理，可以通过与企业的沟通协商、申请劳动仲裁或提起诉讼等方式维护自己的合法权益。

可能的法律后果：

• 如果企业依据不合法的内部文件发出警告单，可能会面临劳动行政部门的处罚，如责令改正、罚款等。
• 同时，员工也可能因此遭受不必要的精神压力和经济损失，企业可能需要承担相应的赔偿责任。

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