可以起诉。针对您提出的“单位委托个人担任部门经理，借款用于经营能否起诉”的问题，我们可以从以下几个角度进行详细分析：
一、法律关系分析
借款合同关系：
- 如果单位（借款人）与出借人之间签订了书面的借款合同，或者虽然没有书面合同但存在事实上的借款关系（如转账记录、借款凭证等），那么出借人就有权基于借款合同关系向单位主张还款。
- 在此情况下，部门经理作为单位的代理人或员工，其借款行为通常被视为职务行为，除非有证据表明其借款行为超出了职务范围或未经单位授权。
委托代理关系：
- 如果单位委托部门经理个人进行借款，且该委托行为有明确的书面授权或可以推断出单位有此意图（如单位知晓并默认部门经理的借款行为），那么部门经理的借款行为在法律上可能被视为代表单位的行为。
- 在此情况下，出借人可以直接向单位主张还款，因为部门经理的借款行为在法律上被视为单位的行为。
二、起诉条件与程序
起诉条件：
- 出借人需要证明与单位之间存在借款关系，这可以通过借款合同、转账记录、借款凭证等证据来证明。
- 出借人还需要证明单位未按照约定履行还款义务，这可以通过催款记录、还款计划等证据来证明。
起诉程序：
- 出借人可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，要求单位偿还借款本金及利息（如有约定）。
- 在诉讼过程中，出借人需要提交相关证据来支持其主张，并可能需要接受法院的调查和询问。
三、可能面临的法律后果
如果单位败诉：
- 单位需要按照法院的判决履行还款义务，包括偿还借款本金及利息（如有约定）。
- 如果单位未按照判决履行还款义务，出借人可以申请法院强制执行，包括查封、扣押、拍卖单位的财产等。
如果出借人证据不足：
- 如果出借人无法提供足够的证据来证明与单位之间存在借款关系或单位未按照约定履行还款义务，那么法院可能会驳回出借人的诉讼请求。
四、建议与注意事项
收集证据：
- 出借人在起诉前应该尽可能收集与借款相关的证据，包括借款合同、转账记录、借款凭证、催款记录等。
- 如果可能的话，出借人还可以尝试获取单位对借款行为的认可或确认的证据，如单位出具的借款说明、还款计划等。
咨询专业律师：
- 在起诉前或诉讼过程中，出借人可以咨询专业律师的意见和建议，以确保其权益得到最大程度的保护。
- 律师可以帮助出借人分析法律关系、制定诉讼策略、准备证据材料等。
注意诉讼时效：
- 出借人需要注意诉讼时效的问题，确保在法定的诉讼时效期间内提起诉讼。
- 如果超过了诉讼时效期间，出借人可能会丧失胜诉权。
总结：单位委托个人担任部门经理借款用于经营的情况下，如果出借人能够证明与单位之间存在借款关系且单位未按照约定履行还款义务，那么出借人就有权向法院提起诉讼要求单位偿还借款。在起诉前或诉讼过程中，出借人应该尽可能收集相关证据并咨询专业律师的意见和建议。如果您有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。