公司自主规定加班费，其合法性取决于具体规定内容是否符合法律法规的强制性要求。以下从不同角度进行分析：
合法情况
加班费标准不低于法定标准：
- 根据我国《劳动法》的规定，工作日加班应支付不低于工资150%的报酬；休息日加班若无法安排补休，则需支付不低于工资200%的报酬；法定节假日加班，则需支付不低于工资300%的报酬。
- 如果公司自主规定的加班费标准等于或高于这些法定标准，并且该规定经过合法程序制定（如民主协商、公示等），那么这种规定是合法的。
经过民主协商与公示：
- 公司制定加班费规定时，应遵循合法程序，包括与员工或员工代表进行民主协商，并将规定进行公示，确保员工知晓并同意。
- 如果公司按照这些程序制定了加班费规定，并且规定内容合法，那么这种规定也是合法的。
违法情况
加班费标准低于法定标准：
- 如果公司自主规定的加班费标准低于法定标准，那么这种规定是违法的。
- 例如，公司规定工作日加班只支付100%的工资报酬，这就低于了法定150%的标准，因此是违法的。
未经过合法程序制定：
- 如果公司没有按照合法程序（如民主协商、公示等）制定加班费规定，或者规定内容未经员工同意，那么这种规定也可能是违法的。
- 例如，公司单方面制定加班费规定，并未与员工进行协商或公示，这种规定就可能因缺乏合法性而无效。
法律建议
- 员工角度：如果公司制定的加班费规定违法或不合理，员工有权向公司提出异议，并要求公司按照法定标准支付加班费。如果公司拒绝改正，员工可以向劳动监察部门投诉或通过劳动仲裁维护自身权益。
- 公司角度：为了避免法律纠纷和保障员工权益，公司应制定合法、合理的加班费规定，并确保规定内容经过合法程序制定和公示。同时，公司也应按照规定及时、足额支付加班费给员工。
举例说明：假设某公司规定，工作日加班支付120%的工资报酬，而法定标准为150%。这种规定就低于了法定标准，因此是违法的。员工有权要求公司按照法定标准支付加班费，如果公司拒绝，员工可以通过法律途径维护自身权益。
总之，公司自主规定加班费时，必须确保规定内容符合法律法规的强制性要求，并经过合法程序制定和公示。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。