公司以男同事抽烟为借口扣除别人的奖金，这一行为通常是不合法的。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律依据与奖金性质
首先，我们需要明确奖金的性质。奖金是员工因工作表现优异、达到或超过公司设定的目标而获得的额外报酬，它属于员工劳动报酬的一部分。根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬，包括奖金。
二、公司扣除奖金的合法性分析
扣除理由的合理性：
- 公司以男同事抽烟为借口扣除其他员工的奖金，这一理由显然与员工的个人工作表现和业绩无关。抽烟行为，除非它直接违反了公司的规章制度且该规章制度与工作表现、业绩紧密相关（例如，某些特定岗位如化工操作员因抽烟可能引发安全事故），否则不能作为扣除奖金的合理依据。
- 如果抽烟行为并未违反公司规章制度，或者规章制度中并未明确规定抽烟将导致奖金扣除，那么公司的这一行为就缺乏合法依据。
公司规章制度的合法性：
- 即使公司规章制度中规定了抽烟将导致奖金扣除，也需要审查该规章制度的合法性。规章制度必须经过民主程序制定，且内容不得违反法律法规的强制性规定。
- 如果规章制度未经民主程序制定，或者内容违法，那么它不能作为公司扣除员工奖金的依据。
个别扣除与全体扣除的区别：
- 如果公司仅针对个别抽烟的员工扣除奖金，且这些员工确实违反了公司规章制度中关于抽烟的规定，那么这一行为可能具有一定的合法性（但需进一步审查规章制度的合法性和合理性）。
- 然而，在本案例中，公司是以“男同事抽烟”为借口扣除“别人”的奖金，这涉及到了对非抽烟员工的处罚，显然缺乏合法性和合理性。
三、可能的法律后果与建议
法律后果：
- 如果公司无正当理由扣除员工奖金，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付被扣除的奖金及可能的赔偿金。
- 劳动行政部门也有权对公司进行处罚，要求其改正违法行为并支付员工应得的劳动报酬。
建议：
- 对于受到不公正待遇的员工，建议首先与公司进行沟通协商，要求公司说明扣除奖金的具体理由和依据。
- 如果沟通无果，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向劳动行政部门投诉举报。
- 在整个过程中，员工应保留好相关证据（如劳动合同、工资条、公司规章制度等），以便在需要时维护自己的合法权益。
综上所述，公司以男同事抽烟为借口扣除别人的奖金是不合法的。员工有权要求公司支付被扣除的奖金，并可以通过法律途径维护自己的合法权益。如果你或你身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。