因抽烟被扣工资是否合法，需分情况讨论：

1. 若公司规章制度明确规定抽烟属于违纪行为，并明确规定了相应的处罚措施，包括扣工资，且该规章制度已经过民主程序制定并公示或告知劳动者，同时扣工资的幅度未超过法定限制，那么公司因员工抽烟而扣工资的行为是合法的。

   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
   • 实际操作：公司需确保规章制度的合法性、合理性，并经过民主程序制定，同时扣工资的幅度需符合法律法规的规定，如不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。

2. 若公司规章制度未明确规定抽烟属于违纪行为或未规定相应的处罚措施，或者规章制度未经民主程序制定并未公示或告知劳动者，或者扣工资的幅度超过了法定限制，那么公司因员工抽烟而扣工资的行为则是不合法的。

   • 法律依据：同样依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位的规章制度需经过民主程序制定并公示或告知劳动者，且扣工资的幅度需符合法律法规的规定。
   • 实际操作：若公司规章制度存在上述问题，劳动者有权向公司提出异议，并要求公司纠正违法行为。若公司拒绝纠正，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

建议与提醒：

• 对于公司：应确保规章制度的合法性、合理性，并经过民主程序制定并公示或告知劳动者。在制定处罚措施时，应明确、具体，并符合法律法规的规定。
• 对于劳动者：应了解并遵守公司的规章制度，若认为公司的规章制度存在违法或不合理之处，有权向公司提出异议。若因公司违法行为导致自身权益受损，应及时向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

特殊情况说明：

• 若员工在工作时间、工作场所内抽烟，且该行为违反了公司的安全生产规定或消防安全规定，公司有权依据规章制度对员工进行处罚，但处罚措施需合法、合理。
• 若员工因抽烟导致公司财产损失或他人人身伤害，公司有权要求员工承担赔偿责任，但赔偿金额需与实际损失相符，且不得通过扣工资的方式随意扩大赔偿范围。

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