结论前置：针对您提出的“劳动者主张当时是经单位同意离职的，但是档案又是除名，劳动者并不清楚”这一问题，关键在于明确离职性质、收集证据并考虑通过法律途径解决。以下是从不同角度给出的详细分析和建议。
一、明确离职性质与档案记录的关系
离职性质：首先，需要明确您当时的离职是自愿离职还是被单位除名。自愿离职通常意味着您主动提出了离职申请，并与单位达成了离职协议；而被除名则可能是单位因您违反了单位规章制度或法律法规而作出的处理决定。
档案记录：档案中的“除名”记录通常意味着单位认为您存在严重违纪行为，因此作出了除名处理。然而，如果您实际上并未违反单位规章制度或法律法规，且当时是经单位同意离职的，那么档案中的“除名”记录可能与实际情况不符。
二、收集证据以证明离职性质
离职协议或文件：如果您当时与单位签订了离职协议或收到了离职通知等文件，这些文件可以作为证明您离职性质的直接证据。
同事证言：如果有同事可以证明您当时是经单位同意离职的，他们的证言也可以作为辅助证据。
沟通记录：如果您与单位之间有关于离职的沟通记录（如邮件、短信、微信等），这些记录也可以作为证明您离职性质的证据。
三、考虑通过法律途径解决
劳动仲裁：如果您认为档案中的“除名”记录与实际情况不符，且影响了您的就业或其他权益，您可以考虑向劳动仲裁机构提起劳动仲裁，要求单位更正档案记录或赔偿损失。
诉讼途径：如果劳动仲裁未能解决您的问题，您还可以考虑向法院提起诉讼，通过司法程序来维护自己的合法权益。
四、注意事项与建议
及时行动：如果您发现档案中的记录与实际情况不符，建议尽快采取行动，以免因时间拖延而增加解决问题的难度。
保留证据：在采取任何行动之前，请确保您已经收集并保留了足够的证据来证明您的离职性质和档案记录的不符之处。
咨询专业律师：虽然我在这里为您提供了一些建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在采取任何法律行动之前，我建议您咨询一位专业的劳动法律师，以便获得更具体、更个性化的法律建议。
最后，如果您在处理这个问题过程中遇到任何困难或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会尽我所能为您提供专业的法律支持和建议。