结论：在劳动仲裁调解后工资已全部结清的情况下，若商家又主张劳动关系，需根据具体情况分析处理。一般来说，若调解协议已明确双方劳动关系终止或解除，且无其他争议，商家再主张劳动关系可能缺乏依据；但若存在特殊情况或调解协议未明确，则需进一步核查事实并依据法律处理。
分析：
调解协议的内容与效力：
- 劳动仲裁调解书是具有法律效力的文书，一旦双方签字确认，即表示对调解内容的认可。若调解协议中明确规定了工资结清后双方劳动关系终止或解除，且无其他争议，那么商家在事后又主张劳动关系，可能缺乏法律依据。
- 若调解协议未明确提及劳动关系的终止或解除，或者仅规定了工资结清而未涉及劳动关系状态，那么商家主张劳动关系可能存在一定的合理性，但需要进一步核查事实。
劳动关系的认定标准：
- 劳动关系的认定通常依据双方签订的劳动合同、实际用工情况、工资支付记录等因素。若商家在调解后主张劳动关系，需要提供充分的证据证明双方仍存在劳动关系，如继续用工的证据、工资支付记录等。
- 若商家无法提供充分证据，而劳动者能够证明调解后双方已无实际用工关系，那么商家的主张可能难以得到支持。
可能的法律后果与应对策略：
- 若商家无理主张劳动关系，可能构成对劳动者的骚扰或侵权，劳动者有权要求商家停止侵害、赔偿损失等。
- 劳动者在面对商家主张时，应首先核查调解协议的内容，明确双方的权利义务。若商家主张缺乏依据，劳动者可以拒绝承认，并保留相关证据以备不时之需。
- 若双方无法协商解决，劳动者可以向劳动监察部门投诉或再次申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
建议：
- 劳动者在签订调解协议时，应确保协议内容明确、具体，涵盖所有争议点，包括劳动关系的终止或解除。
- 劳动者在调解后应保留好相关证据，如调解协议、工资支付记录等，以备不时之需。
- 若商家在调解后又主张劳动关系，劳动者应及时咨询专业律师，了解自己的权利义务，并制定相应的应对策略。
特殊情况说明：
- 若调解协议存在瑕疵或未明确规定的事项，导致商家主张劳动关系具有一定的合理性，那么双方应进一步协商解决或通过法律途径解决争议。
- 在处理此类争议时，应遵循公平、公正、合法的原则，确保双方的合法权益得到保障。
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