针对您提出的“工伤之后公司在哪就在那申请，还是在施工的地方申请”的问题，这实际上涉及到工伤认定申请的受理管辖问题。

首先，我们需要明确的是，当用人单位的注册地与生产经营地不在同一统筹地区时，工伤认定申请的受理管辖会有特定的规定。根据相关规定及实践案例，我们可以得出以下结论：

1. 如果用人单位已经参加了工伤保险：

   • 工伤认定申请通常应在参保地进行。这意味着，如果公司已经为员工在某个地区缴纳了工伤保险，那么员工发生工伤后，应向该参保地的工伤保险部门申请工伤认定。

2. 如果用人单位未参加工伤保险：

   • 根据人力资源社会保障部《关于执行<工伤保险条例>若干问题的意见》(二)的相关规定，未参加工伤保险的职工，应当在生产经营地进行工伤认定。这里的“生产经营地”指的是用人单位具体生产、经营、办公的所在地，或者从业人员存在相对固定工作场所的，该工作场所可视为生产经营地。
   • 在您提到的施工场景中，如果施工地点是公司实际的生产经营地，且公司未在该地为员工参加工伤保险，那么员工发生工伤后，应向施工地点（即生产经营地）的工伤保险部门申请工伤认定。

3. 特殊情况处理：

   • 如果用人单位的生产经营地涉及两个及以上行政区，且区人力资源和社会保障局对受理管辖有争议，那么这些部门应当协商处理；协商不成的，可报请市人力资源社会保障局指定管辖。

结合您提供的案例，吴某在船舶停靠的宜昌市猇亭云池港发生工伤事故，而该船舶的航运公司注册地在河南固始。由于航运公司未为吴某缴纳工伤保险，且宜昌市作为船舶停靠和吴某实际提供劳动的场所，可以视为生产经营地。因此，吴某向宜昌市人社局申请工伤认定是符合规定的。

综上所述，工伤之后申请工伤认定的地点，并非单纯取决于公司的注册地或施工地点，而是需要根据公司的参保情况、生产经营地的具体位置以及相关规定来确定。如果公司未参加工伤保险，且施工地点是实际的生产经营地，那么员工应向施工地点的工伤保险部门申请工伤认定。