您好，关于就业协议书上的组织机构代码不填是否有影响的问题，这主要取决于您所签署的就业协议书的具体要求以及相关法律法规的规定。

首先，我们需要明确的是，组织机构代码是组织机构在法律上的唯一标识，它对于确认组织的身份、进行法律事务处理以及享受相关政策和服务都至关重要。在就业协议书中，组织机构代码通常用于确认用人单位的身份和合法性。

从法律法规的角度来看：

根据国家发展改革委办公厅发布的《关于在办理相关业务中使用统一社会信用代码的通知》，自2018年6月30日起，机关事业单位、社会团体、基金会、民办非企业单位等组织机构代码证和未加载统一社会信用代码的登记证照已停止使用，改为使用加载统一社会信用代码的登记证照。这意味着，如果您的用人单位属于这些类别，并且其证照已经更新为加载统一社会信用代码的版本，那么在就业协议书中填写相应的统一社会信用代码是必要的。

从就业协议书的实际作用来看：

就业协议书是用人单位和求职者之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。组织机构代码（或统一社会信用代码）作为用人单位身份的重要标识，其填写有助于确保协议的合法性和有效性。如果协议书中未填写组织机构代码，可能会在后续办理相关手续（如社保、公积金等）时遇到麻烦，甚至可能影响协议的履行。

建议：

1. 确认用人单位的证照情况：了解用人单位是否已经更新为加载统一社会信用代码的证照，并获取相应的代码。
2. 填写完整信息：在签署就业协议书时，务必填写用人单位的组织机构代码（或统一社会信用代码），以确保协议的合法性和有效性。
3. 咨询相关部门：如果您对组织机构代码的填写有疑问，或者不确定用人单位的证照情况，可以咨询当地的人社部门或相关机构进行确认。

综上所述，就业协议书上的组织机构代码（或统一社会信用代码）的填写对于确保协议的合法性和有效性至关重要。因此，建议您在签署协议时务必填写完整的信息。