针对合同内的工程量被别人做了的情况，认定方式主要依赖于施工过程中形成的书面文件及其他相关证据。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、依据签证等书面文件确认
签证文件的重要性：
- 在建设工程施工过程中，签证等书面文件是确认工程量发生及完成情况的重要依据。这些文件通常由发包人、承包人或监理单位签署，具有法律效力。
- 如果合同内的工程量被他人完成，且存在相应的签证文件，那么这些文件将成为认定工程量归属的关键证据。
签证文件的缺失处理：
- 如果无法提供签证文件来证明工程量是由他人完成的，那么需要依据其他证据来确认实际发生的工程量。
- 这些其他证据可能包括施工日志、会议纪要、照片、视频、付款记录等，它们能够间接证明工程量的完成情况。
二、法律依据及司法解释
- 根据《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释(一)》的相关规定，当事人对工程量有争议的，应首先按照施工过程中形成的签证等书面文件进行确认。
- 如果承包人能够证明发包人同意其施工，但未能提供签证文件证明工程量发生的，那么可以按照当事人提供的其他证据来确认实际发生的工程量。
三、实际操作中的建议
收集并保存证据：
- 在发现合同内的工程量被他人完成后，应立即收集并保存所有可能的证据，包括签证文件、施工日志、照片、视频等。
- 这些证据将有助于在后续的法律纠纷中证明工程量的归属。
与对方协商：
- 在收集到足够证据后，可以尝试与对方进行协商，寻求和解或达成其他协议。
- 协商过程中，应明确表达自己的立场和诉求，并尝试达成双方都能接受的解决方案。
寻求法律途径解决：
- 如果协商无果，或者对方拒绝承认工程量是由其完成的，那么可以考虑通过法律途径来解决纠纷。
- 在此过程中，建议咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。
四、可能面临的法律后果
- 如果无法证明合同内的工程量是由他人完成的，那么可能会面临无法追回相应工程款的风险。
- 如果对方恶意侵占工程量，并因此获得了不当利益，那么还可能面临法律责任，包括赔偿损失等。
综上所述，针对合同内的工程量被别人做了的情况，认定方式主要依赖于签证等书面文件及其他相关证据。在处理此类纠纷时，建议收集并保存所有可能的证据，与对方进行协商，并在必要时寻求法律途径解决。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。