核心结论：公司未及时转正且罚款扣工资的行为可能违法，您有权要求公司补发工资、赔偿损失，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。以下是具体分析：

1. 关于未及时转正的问题

• 法律依据：根据《劳动合同法》第19条，劳动合同期限3个月以上不满1年的，试用期不得超过1个月；1年以上不满3年的，试用期不得超过2个月；3年以上或无固定期限的，试用期不得超过6个月。若您已工作3个月仍未转正，且合同约定的试用期超过法定上限，公司行为违法。
• 赔偿建议：您可要求公司按转正后的工资标准补发试用期与转正后的工资差额，并主张公司立即办理转正手续。

2. 关于罚款扣工资的问题

• 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第16条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，但每月扣除部分不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。公司无权单方面以“罚款”名义扣工资，除非能证明您存在重大过失或故意行为导致损失。
• 赔偿建议：若公司无法证明损失与您直接相关，或扣款比例超过法定上限，您可要求公司全额返还被扣工资，并可主张按被扣金额的50%-100%加付赔偿金（需通过劳动仲裁）。

3. 维权途径

• 协商解决：先与公司沟通，要求出具书面扣款依据及转正通知，保留证据（如工资条、考勤记录、劳动合同等）。
• 投诉举报：向当地劳动监察大队投诉（可通过12333热线），要求查处公司违法行为。
• 劳动仲裁：若协商无果，可申请劳动仲裁，主张补发工资、赔偿金及经济补偿（如公司以此为由解除合同，可主张2N赔偿）。

4. 注意事项

• 证据收集：务必保留劳动合同、工资条、扣款通知、沟通记录等证据，这是维权的关键。
• 时效限制：劳动仲裁时效为1年，自知道或应当知道权利被侵害之日起计算，建议尽快行动。

总结：公司的行为涉嫌违法，您有权通过法律途径维护权益。若需进一步帮助，可直接向我咨询具体操作步骤或证据整理方法。