《女职工劳动保护特别规定》是适用于事业单位的。以下是对此问题的详细分析：
法律依据
根据《女职工劳动保护特别规定》的第二条，明确规定了该规定的适用范围：“中华人民共和国境内的国家机关、企业、事业单位、社会团体、个体经济组织以及其他社会组织等用人单位及其女职工，适用本规定。” 这一条款直接表明了事业单位及其女职工是该规定的适用对象。
规定内容
《女职工劳动保护特别规定》旨在减少和解决女职工在劳动中因生理特点造成的特殊困难，保护女职工的健康。它涵盖了女职工在孕期、产期、哺乳期等特殊时期的劳动保护，以及用人单位应遵守的女职工禁忌从事的劳动范围等规定。这些规定对于事业单位同样适用，确保了事业单位女职工能够享受到与国家机关、企业等其他用人单位女职工同等的劳动保护权益。
实际应用
在实际操作中，事业单位应当严格遵守《女职工劳动保护特别规定》的相关要求，为女职工提供必要的劳动保护措施。例如，对于怀孕7个月以上的女职工，不得延长劳动时间或者安排夜班劳动，并应当在劳动时间内安排一定的休息时间；对于哺乳未满1周岁婴儿的女职工，不得延长劳动时间或者安排夜班劳动，并应当在每天的劳动时间内为哺乳期女职工安排1小时哺乳时间等。
法律责任
如果事业单位违反《女职工劳动保护特别规定》，侵害女职工的合法权益，将依法承担相应的法律责任。这包括但不限于责令限期改正、处以罚款、给予赔偿等。同时，如果用人单位及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。
总结与建议：
《女职工劳动保护特别规定》明确适用于事业单位及其女职工。事业单位应当严格遵守该规定的相关要求，为女职工提供必要的劳动保护措施。如果女职工在事业单位中遇到劳动保护方面的问题，可以依法向相关部门投诉、举报或申诉，维护自己的合法权益。如果您在事业单位工作并遇到了相关劳动保护问题，或者有任何其他法律问题，都可以直接向我咨询，我会尽力为您提供专业的法律帮助。