针对您提出的“出租车因病退车扣违约金合法吗”这一问题，我会结合相关法律法规和实际情况，为您进行详细解答。

首先，我们需要明确的是，出租车司机因病退车是否构成违约，以及是否需要支付违约金，这主要取决于两个方面的因素：一是司机是否处于合法医疗期内，二是租车合同中是否有关于违约金的明确约定。

一、司机是否处于合法医疗期内

根据法律规定，劳动者在医疗期内享有合法正当的不提供劳动的理由，单位不能因此认定其违约。如果出租车司机因病无法继续工作，且处于合法医疗期内，那么他因病退车并不构成违约。此时，出租车公司应依法保障司机的医疗待遇，不得因此解除合同或采取其他不利措施。

二、租车合同中是否有关于违约金的明确约定

关于出租车司机的违约金规定，应严格遵循《劳动合同法》的相关规定。根据该法第二十五条，除特定情形外（如用人单位提供专项培训费用并约定服务期、约定保守商业秘密和竞业限制条款等），用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。

1. 如果合同未约定有效违约金条款：

   • 若司机因病退车且合同未约定有效违约金条款，则公司无权要求司机支付违约金。

2. 如果合同中存在有效违约金条款：

   • 若合同中存在有效违约金条款，且司机违反相关约定（如服务期未满擅自离职等），则公司有权依据合同条款要求司机支付相应违约金。但在此情况下，如果司机因病无法继续工作且处于合法医疗期内，这一条款可能不适用，因为司机并非主观上故意违约。

三、建议与出租车公司协商

如果司机因病情严重无法继续管理出租车，建议及时与出租车公司进行沟通，说明病情及退车意愿。在协商过程中，可以尝试达成退车协议，明确双方的权利和义务，包括是否需要支付违约金以及支付的具体金额等。如果协商不成，可以考虑通过法律途径解决争议。

综上所述，出租车因病退车是否扣违约金，需要综合考虑司机是否处于合法医疗期内以及租车合同中是否有关于违约金的明确约定。如果司机因病无法继续工作且处于合法医疗期内，且合同未约定有效违约金条款，则公司无权要求司机支付违约金。如果合同中存在有效违约金条款，但司机因病无法继续工作，建议及时与出租车公司协商解决。