损害公司利益纠纷在符合一定条件下可以约定由仲裁管辖。以下从不同角度进行详细分析：

一、仲裁管辖的法律依据与原则

根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。这表明，只要纠纷属于合同纠纷或其他财产权益纠纷，且双方当事人自愿达成仲裁协议，就可以选择仲裁作为解决纠纷的方式。损害公司利益纠纷，如果涉及合同关系或财产权益争议，且双方有仲裁协议，理论上可以约定仲裁管辖。

二、损害公司利益纠纷的具体情形与仲裁管辖

1. 合同型损害公司利益纠纷：

   • 如果损害公司利益的行为是基于合同关系产生的，例如股东或高管违反与公司签订的合同，损害公司利益，那么双方可以在合同中约定仲裁条款，选择仲裁作为解决纠纷的方式。
   • 示例：股东与公司签订投资协议，约定股东需按期出资。若股东未履行出资义务，损害公司利益，公司可以根据投资协议中的仲裁条款，向仲裁机构申请仲裁。

2. 非合同型损害公司利益纠纷：

   • 对于非合同型的损害公司利益纠纷，如股东滥用权利、公司高管违反忠实义务等，虽然这些行为可能不直接涉及合同关系，但双方仍可以通过协商，达成仲裁协议，约定将此类纠纷提交仲裁解决。
   • 关键点：非合同型纠纷的仲裁管辖依赖于双方的仲裁协议。没有仲裁协议，仲裁机构无权受理。

三、仲裁协议的有效性要件

要使损害公司利益纠纷能够约定由仲裁管辖，必须满足仲裁协议的有效性要件：

1. 双方自愿：仲裁协议必须是双方当事人真实意思的表示，不能存在欺诈、胁迫等情形。
2. 明确具体：仲裁协议应明确约定仲裁事项、仲裁机构和仲裁规则等关键内容。
3. 不违反法律：仲裁协议的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定。

四、实务建议与风险提示

1. 实务建议：

   • 在签订涉及公司利益的合同时，建议明确约定仲裁条款，以便在发生纠纷时能够迅速、有效地解决。
   • 对于非合同型的损害公司利益纠纷，双方可以通过协商，达成书面的仲裁协议，明确仲裁管辖。

2. 风险提示：

   • 如果没有有效的仲裁协议，仲裁机构将无权受理损害公司利益纠纷。
   • 仲裁裁决具有终局性，一旦作出，对双方当事人均具有约束力。因此，在约定仲裁管辖前，应充分评估仲裁的风险和成本。

总结来看，损害公司利益纠纷在符合一定条件下可以约定由仲裁管辖，关键在于双方是否自愿达成有效的仲裁协议。如果您在实务中遇到此类问题，或有其他公司法务方面的疑问，欢迎直接向我咨询。