若公司和员工在劳动仲裁处签订了协议，但员工后续认为协议存在问题，可采取以下措施：

1. 审查协议内容：

   • 首先，员工应详细审查协议内容，确认是否存在误解或遗漏。协议中的条款应清晰明确，包括但不限于工资支付、工作条件、福利待遇、违约责任等。
   • 若发现协议中存在模糊不清、显失公平或违反法律法规的条款，员工有权提出异议。

2. 与用人单位协商：

   • 员工可以尝试与用人单位进行友好协商，就协议中的问题达成一致意见，并签订补充协议以修正原协议中的不足。
   • 协商过程中，员工应保留好相关证据，如沟通记录、邮件往来等，以备不时之需。

3. 申请劳动仲裁委员会重新审查或撤销：

   • 若协商无果，员工可以向劳动仲裁委员会提出申请，要求重新审查或撤销原协议。
   • 根据《劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动仲裁委员会对仲裁裁决有监督权，若发现裁决存在错误，可以依法予以撤销或更正。但需注意，此途径通常针对仲裁裁决本身存在违法或明显不当的情形，若仅是协议内容问题，可能需结合其他途径。
   • 更常见的做法是：员工可以就协议履行过程中产生的新争议，再次向劳动仲裁委员会提起仲裁申请，要求对原协议未涵盖或处理不当的事项进行裁决。

4. 向人民法院提起诉讼：

   • 若劳动仲裁委员会不予受理或员工对仲裁结果不满意，员工可以向人民法院提起诉讼。
   • 在诉讼过程中，员工需要提供充分的证据证明协议存在问题，如协议文本、沟通记录、相关法律法规等。
   • 法院将根据事实和法律规定，对协议的有效性进行审查，并作出相应的判决。

5. 寻求法律援助或咨询：

   • 在整个过程中，员工可以寻求法律援助或咨询专业律师，以获取更专业的法律意见和帮助。
   • 律师可以协助员工审查协议内容、准备相关证据、参与协商或诉讼等，以维护员工的合法权益。

法律背景与建议：

• 劳动仲裁协议是双方自愿达成的具有法律效力的文件，一旦签订，双方应严格遵守。但若协议存在违法、显失公平或重大误解等情形，员工有权提出异议并寻求法律救济。
• 在处理此类问题时，员工应保持冷静和理性，避免采取过激行为。同时，应积极收集证据、咨询专业律师，以制定合理的维权策略。

可能的法律后果：

• 若员工能够证明协议存在问题并成功维权，用人单位可能需要承担违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
• 若员工未能提供充分证据或法律程序不当，可能导致维权失败，甚至承担不必要的法律责任。

因此，建议员工在认为协议存在问题时，及时咨询专业律师并采取相应的法律措施以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。