事业单位一年发一次工资是否违法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下是对此问题的详细分析：
合法情形
特殊约定或协议：
- 若事业单位与员工之间存在特殊约定或协议，如年薪制、项目制薪酬等，且该约定或协议不违反法律法规，那么一年发一次工资可能是合法的。但这种情况较为特殊，且需要双方明确同意并签订书面协议。
特定情况下的工资暂停：
- 在某些特定情况下，如员工涉嫌违法违纪被立案调查期间，单位可能根据干部人事管理权限暂停其工资待遇。但这种情况是暂时的，且需要遵循法定程序和规定。
违法情形
无正当理由拖欠工资：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。若事业单位无正当理由一年只发一次工资，显然违反了这一规定，属于违法行为。
违反劳动合同或规章制度：
- 若事业单位与员工签订的劳动合同或单位规章制度中明确规定了工资支付方式和时间，而单位未按照约定或规定执行，一年只发一次工资，那么这也构成违法行为。
法律建议
对于事业单位：
- 应建立健全的薪酬管理制度，明确工资支付方式和时间，并确保员工知晓。
- 遵循法定程序和规定，不得无故拖欠或克扣员工工资。
- 若因特殊原因需要暂停或调整工资支付，应提前与员工沟通并达成一致。
对于员工：
- 若认为单位一年发一次工资违法，可先与单位沟通协商，要求单位按照约定或规定支付工资。
- 若沟通无果，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
可能的法律后果
- 若事业单位一年发一次工资被认定为违法行为，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令限期支付工资、加付赔偿金等。
- 同时，员工也有权依法向当地人民法院申请支付令，要求单位支付拖欠的工资。
综上所述，事业单位一年发一次工资是否违法需根据具体情况判断。若存在正当理由且遵循法定程序和规定，可能是合法的；但若无正当理由或违反劳动合同和规章制度，则构成违法行为。在实际操作中，单位和员工都应遵守相关法律法规，确保工资支付行为的合法性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。