关于收费站上班六小时休12小时是否合法的问题，需结合具体法律规定和实际情况进行分析，结论如下：

1. 从工时制度角度分析：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。若收费站实行的是标准工时制，即每日工作八小时、每周工作四十小时，那么上班六小时休12小时的安排，在单日来看并未超过法定工作时间，但需考虑整体周工作时间是否合规。若该安排导致周工作时间超过四十四小时，则可能不合法。
   • 若收费站实行的是不定时工作制或综合计算工时工作制，这两种工时制度需经劳动行政部门批准。在不定时工作制下，劳动者的工作时间不受固定时间限制；在综合计算工时工作制下，劳动者的工作时间可以在一定周期内综合计算。若收费站已依法获得批准并实行这两种工时制度之一，且上班六小时休12小时的安排符合该制度的要求，则可能是合法的。

2. 从休息休假权利角度分析：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第三十八条，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。上班六小时休12小时的安排，若能保证劳动者每周有足够的休息时间，且不违反其他关于休息休假的规定，则从休息休假权利的角度来看，可能是合法的。
   • 同时，劳动者还有权享受法定节假日、年休假等休息休假权利。若收费站的安排侵犯了劳动者的这些权利，则可能不合法。

3. 从劳动合同和规章制度角度分析：

   • 劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。若劳动合同中明确规定了上班六小时休12小时的工时制度，且该制度不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，则可能是合法的。
   • 用人单位的规章制度也是判断工时制度是否合法的重要依据。若收费站的规章制度中规定了上班六小时休12小时的工时制度，且该制度已经过民主程序制定并公示给劳动者，同时不违反法律、行政法规的强制性规定，则可能是合法的。

建议与风险提示：

• 若您对收费站的工时制度存在疑问或认为其不合法，建议您首先查阅与用人单位签订的劳动合同以及用人单位的规章制度，了解其中关于工时制度的具体规定。
• 若发现劳动合同或规章制度中的规定违反法律、行政法规的强制性规定，或用人单位未按照约定履行工时制度，您可以与用人单位进行协商，要求其改正。若协商无果，您可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

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