结论：在已经进行劳动仲裁但法人代表还不知道的情况下，您可以从确保仲裁程序合法性、考虑法人代表知情权、以及准备后续应对措施等多个角度来处理。

一、确保仲裁程序合法性

1. 审查仲裁程序：首先，您需要确认劳动仲裁的程序是否合法，包括仲裁申请的提交、受理、开庭、裁决等各个环节是否符合《劳动争议调解仲裁法》及相关规定。只要仲裁程序本身合法，法人代表是否知晓并不影响仲裁的效力。

2. 仲裁文书送达：根据法律规定，仲裁机构应当将仲裁文书送达给当事人。如果法人代表确实不知道仲裁事宜，可能是送达环节出现了问题。您可以联系仲裁机构，确认仲裁文书是否已经依法送达给公司，并保留好送达回证等相关证据。

二、考虑法人代表知情权

1. 及时通知法人代表：从尊重法人代表知情权的角度出发，您可以考虑在仲裁程序进行中或裁决后，及时将仲裁情况通知给法人代表。这有助于法人代表了解公司面临的法律风险，并采取相应的应对措施。

2. 法人代表参与后续程序：如果仲裁裁决后公司需要履行相关义务（如支付赔偿金等），法人代表作为公司的法定代表人，可能需要参与后续的执行程序。因此，提前通知法人代表并让其了解仲裁情况，有助于后续程序的顺利进行。

三、准备后续应对措施

1. 执行裁决：如果仲裁裁决已经生效，且公司未履行相关义务，您可以向人民法院申请强制执行。在此过程中，法人代表作为公司的法定代表人，可能会被要求配合执行工作。

2. 应对可能的异议或诉讼：如果法人代表在得知仲裁情况后提出异议或提起诉讼（如申请撤销仲裁裁决等），您需要做好相应的应对准备。这包括收集证据、准备法律文书、咨询专业律师等。

四、特别提示

• 保持沟通：在整个过程中，建议您与公司保持沟通，尽量通过协商解决问题。这有助于减少法律纠纷的成本和时间，也有助于维护公司的声誉和利益。

• 寻求专业帮助：如果您在处理劳动仲裁事宜过程中遇到任何困难或疑问，可以随时向我咨询。作为专业律师，我将为您提供全面的法律支持和建议。

行动建议：

1. 立即联系仲裁机构，确认仲裁文书的送达情况，并保留好相关证据。
2. 考虑及时通知法人代表仲裁情况，并让其了解后续可能面临的法律责任。
3. 准备应对可能的异议或诉讼，包括收集证据、准备法律文书等。
4. 如需进一步帮助，请随时向我咨询。