没收违法所得的违建房，罚款通常是按照批准工程的造价来计算，而非单纯的建筑面积或违建部分造价。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据与罚款计算方式

根据《云南省城乡规划条例》第四十五条的规定，对于未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的行为，县级以上人民政府城乡规划主管部门有权责令停止建设，并根据情况采取改正措施或没收实物、违法收入，并处以罚款。具体罚款标准为建设工程造价的5%以上10%以下。这里的“建设工程造价”指的是批准工程的造价，即按照规划许可应建设的工程部分的造价，而非违建部分的造价或整个建筑的造价。

举例说明：

• 若申请建盖的是3层楼房，但实际建盖了4层，那么处罚时依据的是原批准3层楼房的造价，而非超出部分的1层造价，也不是3、4层的总价。

二、不同情况下的处理方式

1. 尚可采取改正措施的情况：

   • 如果违建部分可以通过改正措施消除对规划实施的影响，那么相关部门会责令限期改正，并处以建设工程造价5%以上10%以下的罚款。

2. 无法采取改正措施的情况：

   • 如果违建部分无法通过改正措施消除影响，那么相关部门会责令限期拆除。若不能拆除，则会没收实物或违法收入，并同样处以建设工程造价5%以上10%以下的罚款。

三、法律建议与后续行动

• 了解具体规定：由于不同地区的城乡规划条例可能有所不同，因此建议违建者或相关利益方首先了解当地的具体规定，以便更准确地评估罚款金额和可能的法律后果。
• 积极配合处理：在面对违建处罚时，建议违建者积极配合相关部门的处理工作，按照要求采取改正措施或接受处罚，以避免更严重的法律后果。
• 寻求法律帮助：如果违建者对处罚决定有异议或需要进一步的法律帮助，可以及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并寻求合法的解决途径。

如有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。我会根据你的具体情况，提供专业、全面的法律建议。