结论前置：怀孕后期不上班，只要与用人单位的劳动关系仍然存续，公司就应当继续为员工承担社会保险的缴纳义务。
一、法律背景与依据
根据《中华人民共和国社会保险法》第六十条的规定，用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，非因不可抗力等法定事由不得缓缴、减免。这一规定明确了用人单位在劳动关系存续期间，必须按时足额为员工缴纳社会保险的法定义务。同时，《中华人民共和国妇女儿童权益保障法》以及《女职工劳动保护特别规定》等相关法律法规，也进一步强调了孕妇在怀孕阶段应享受到的特别劳动保护权益，包括用人单位不得因女职工怀孕而降低其工资、予以辞退、与其解除劳动或者聘用合同等。
二、具体分析
劳动关系存续是前提：
- 只要女职工与用人单位之间的劳动关系仍然存续，无论女职工是否实际上班，用人单位都应当继续为其缴纳社会保险。这是因为社会保险的缴纳是基于劳动合同关系存续的原则，而非女职工是否实际提供劳动。
社保缴纳责任不变：
- 在女职工怀孕期间，即使因身体原因不能上班，但并未与单位解除劳动关系的情况下，单位和本人应继续按规定缴纳社保。这是双方的法定义务，不因职工暂时无法工作而改变。
单位未缴纳的后果：
- 如果单位未按时足额缴纳社会保险费，社会保险费征收机构将责令限期缴纳或者补足，并自欠缴之日起，按日加收万分之五的滞纳金。此外，女职工还有权通过法律途径维护自己的合法权益，如申请劳动仲裁或向当地劳动保障部门反映并投诉。
三、建议与行动
与单位协商：
- 如果发现单位未按时足额缴纳社会保险费，女职工可以先尝试与用工单位进行协商解决，要求单位补缴社会保险费。
申请劳动仲裁或投诉：
- 如果协商无果，女职工有权申请劳动仲裁或向当地劳动保障部门反映并投诉。这些途径都可以为女职工提供有效的法律保障，确保她们的社保权益不受侵害。
了解产假与社保政策：
- 女职工还应了解自己的产假时间以及产假期间的社保政策。根据《女职工劳动保护特别规定》，女职工生育享受98天产假，其中产前可以休假15天。在这段期间，女职工的社会保险费用仍然需要由单位承担。
四、特殊情况说明
- 如果女职工在怀孕期间与单位解除了劳动关系（如辞职、被辞退等），那么单位就不再承担为其缴纳社会保险的义务。但这种情况并不常见，且通常涉及复杂的法律问题，需要具体分析。
总结：怀孕后期不上班，只要与用人单位的劳动关系仍然存续，公司就应当继续为员工承担社会保险的缴纳义务。如果单位未履行这一义务，女职工有权通过法律途径维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。