若公司不同意您的长期病假申请，您有权依法维护自身权益，具体可通过以下途径解决：

一、优先协商，明确法律依据

1. 与公司友好沟通
   首先，建议您主动与公司人力资源部门或直属领导沟通，说明病情的严重性（如提供医院诊断证明、病假建议书等），并强调您依法享有医疗期的权利。根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工在医疗期内，公司不得随意解除劳动合同或拒绝病假申请。

2. 引用法律条款
   若公司以“影响工作”为由拒绝，您可明确告知：

   • 医疗期长度根据工龄和本单位工作年限确定（如累计工作满10年，在本单位工作满5年，医疗期为6个月）；
     
   • 医疗期内，公司应按不低于当地最低工资标准的80%支付病假工资。

二、申请调解，借助第三方力量

若协商无果，可向以下机构申请调解：

1. 企业内部劳动争议调解委员会（如有）；
   
2. 基层人民调解组织（如街道办、乡镇司法所）；
   
3. 工会组织（若您已加入工会，可请求工会介入协商）。
   

调解优势：程序灵活、成本低，且调解协议具有法律效力，双方签署后需履行。

三、申请劳动仲裁，固定证据维权

若调解失败，您需在知道或应当知道权利被侵害之日起1年内，向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。
关键证据清单：

• 医院出具的病历、诊断证明、病假建议书；
  
• 向公司提交的病假申请记录（如邮件、书面申请）；
  
• 公司拒绝病假的书面回复（如有）；
  
• 工资条、劳动合同（证明劳动关系及工资标准）。
  

仲裁请求示例：

1. 确认公司拒绝病假的行为违法；
   
2. 要求公司支付医疗期内的病假工资差额；
   
3. 若公司以此为由解除合同，可主张违法解除赔偿金（2N倍月工资）。

四、诉讼兜底，维护终极权益

对仲裁裁决不服的，可在收到裁决书之日起15日内向法院提起诉讼。
诉讼策略建议：

• 强调公司拒绝病假的“非合理性”（如未核实病情、未提供替代工作安排）；
  
• 引用《劳动合同法》第38条，若公司未提供劳动条件，您可主张被迫解除合同并要求经济补偿。

五、特别提醒：避免“旷工”风险

若公司未批准病假，您切勿擅自离岗，否则可能被认定为旷工。建议：

1. 每日通过邮件、短信等方式向公司报备病情；
   
2. 保留就医记录，证明您确实处于医疗期；
   
3. 若公司以旷工为由解除合同，您可在仲裁中主张“公司违法解除”。

结语：长期病假争议的核心是“医疗期权利”与“公司管理权”的平衡。您需以证据为盾、以法律为剑，逐步推进维权程序。若过程中遇到具体操作问题（如证据收集、仲裁申请书撰写），可随时向我咨询，我会为您提供详细指导。