长期病假单位是否可以不同意，这主要取决于员工是否符合申请长期病假的条件以及单位的相关规定。以下从几个方面进行详细分析：
医疗期规定：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。
- 在医疗期内，员工享有病假工资或疾病救济费，且单位不得随意解除劳动合同。
- 如果员工处于医疗期内，且提供了有效的医疗证明，单位一般应当同意员工的病假申请。
单位规章制度：
- 单位有权制定自己的规章制度，包括病假管理规定。
- 如果单位的规章制度中明确规定了病假的申请流程、审批权限以及拒绝病假的条件，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么单位在遵循这些规定的前提下，可以拒绝不符合条件的病假申请。
- 但单位规章制度不能剥夺员工在医疗期内应享有的合法权益。
医疗证明的有效性：
- 员工申请病假时，通常需要提供有效的医疗证明，如医院出具的病假条、诊断证明等。
- 如果员工提供的医疗证明不真实或不足以证明其需要长期病假，单位有权拒绝病假申请。
- 单位在拒绝病假申请时，应确保有充分的理由和证据支持其决定。
特殊情况下的处理：
- 如果员工因特殊疾病（如癌症、精神病等）需要长期治疗，且医疗期满后仍不能从事原工作或另行安排的工作，单位应按照相关规定给予相应的待遇或安排。
- 在这种情况下，单位一般不能随意拒绝员工的病假申请。
建议：
- 对于员工而言，如果确实需要申请长期病假，应提前了解单位的规章制度和医疗期规定，确保自己符合申请条件，并准备好有效的医疗证明。
- 对于单位而言，应制定合理的病假管理制度，明确审批流程和拒绝条件，并在拒绝病假申请时确保有充分的理由和证据支持其决定。同时，单位也应关注员工的健康状况，给予必要的关怀和支持。
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