法院以企业经营自主权为由，认为降低工资不属于法院调整范围，从而驳回劳动者起诉，这一做法是否合法，需分情况讨论：
若企业降低工资的行为合法且合理：
- 根据《劳动法》及相关规定，企业确实享有一定的经营自主权，包括在合法合规的前提下调整员工的工资待遇。如果企业降低工资的行为是基于合理的经营需要，如经济困难、业务调整等，并且已经按照法定程序（如与员工协商、提前通知等）进行了操作，那么这种降低工资的行为可能是合法的。
- 在这种情况下，法院可能会认为，降低工资属于企业自主经营权的范畴，不属于法院直接调整的范围，因此驳回劳动者的起诉可能是合法的。但劳动者仍有权通过其他途径（如劳动监察、劳动仲裁等）来维护自己的权益。
若企业降低工资的行为违法或不合理：
- 如果企业降低工资的行为没有合法的依据，或者没有按照法定程序进行，如未经员工同意擅自降低工资、未提前通知等，那么这种行为就是违法的。
- 在这种情况下，法院应当对企业的违法行为进行审查，并保护劳动者的合法权益。如果法院以企业经营自主权为由驳回劳动者的起诉，而忽视了企业行为的违法性，那么这一做法可能是不合法的。劳动者可以依法提起上诉或申请再审，以维护自己的权益。
法律建议：
- 对于劳动者而言，如果认为企业降低工资的行为违法或不合理，应当首先收集相关证据，如工资条、劳动合同、企业通知等，以证明自己的权益受到了侵害。
- 然后，劳动者可以尝试与企业进行协商，寻求和解。如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，或者向劳动仲裁机构申请劳动仲裁。
- 如果对劳动仲裁结果不满，劳动者还可以向法院提起诉讼。在诉讼过程中，劳动者应当充分阐述自己的观点和证据，以争取法院的支持。
可能的法律后果：
- 如果法院最终认定企业降低工资的行为违法，那么企业可能需要补发劳动者的工资差额，并可能面临罚款等法律责任。
- 如果劳动者未能提供充分的证据或未能按照法定程序进行维权，那么其诉求可能得不到法院的支持。
综上所述，法院以企业经营自主权为由驳回劳动者起诉是否合法，取决于企业降低工资的行为是否合法且合理。劳动者在遇到此类问题时，应当积极收集证据并依法维权。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。