人事档案合并时，仅有毕业证而没有学历证明可能会影响档案的完整性和有效性。以下是对此问题的详细分析：

一. 人事档案合并的要求

人事档案是记录个人经历、学历、职称、奖惩等情况的重要文件，对于个人的职业发展、职称评定、社保办理等方面具有重要意义。在合并人事档案时，需要确保档案的完整性和真实性，以便相关部门能够准确了解个人的情况。

二. 毕业证与学历证明的区别

1. 毕业证：是证明个人完成某一阶段学业并取得相应学历的证书。它通常包含了个人的基本信息、学习经历、毕业时间等内容。
2. 学历证明：是证明个人学历情况的官方文件，一般由学校或教育部门出具。它可能包含更详细的信息，如入学时间、学制、所学专业、学历层次等，并且具有更强的官方性和权威性。

三. 仅有毕业证的影响

1. 档案完整性：如果没有学历证明，人事档案中可能会缺少关于个人学历的详细官方记录，从而影响档案的完整性。
2. 学历真实性：在某些情况下，仅凭毕业证可能无法充分证明个人的学历情况。例如，如果毕业证丢失或存在伪造的可能性，学历证明将作为重要的补充证据。

四. 建议

1. 尽量提供学历证明：在合并人事档案时，建议尽量提供学历证明以确保档案的完整性和真实性。如果无法提供原件，可以提供复印件或相关部门的认证文件。
2. 咨询相关部门：如果不确定是否需要提供学历证明，可以咨询公司的人事部门或档案管理部门，了解具体的合并要求和流程。

我的观点：在合并人事档案时，为确保档案的完整性和有效性，建议尽量提供学历证明。如果确实无法提供，可以与相关部门沟通并寻求解决方案。如有进一步需要，您可以继续咨询我。