针对行政诉讼超过时限，法院裁定驳回原告起诉且未查证实体事实的情况，您可以考虑以下几种处理方式：

1. 审查是否存在诉讼时效中断或中止的法定情形：

   • 诉讼时效中断：根据相关法律规定，若在诉讼时效期间内，存在权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务等情形，诉讼时效将中断，并从中断、有关程序终结时起重新计算。您需要仔细审查案件材料，确认是否存在此类中断情形。
   • 诉讼时效中止：若在诉讼时效期间的最后六个月内，因不可抗力或者其他障碍不能行使请求权，诉讼时效将中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。您同样需要确认是否存在此类中止情形。
   • 处理建议：若存在上述法定情形，您可以向法院申请再审，请求撤销原驳回起诉的裁定，并重新审理案件。

2. 与对方协商，重新达成履行义务的约定：

   • 法律背景：超过诉讼时效，原告仅丧失胜诉权，但实体权利仍然存在。若被告自愿履行义务，不受诉讼时效的限制。
   • 处理建议：您可以尝试与对方进行协商，重新达成履行义务的约定。若对方同意，您可以要求对方出具书面协议，明确双方的权利和义务，以便后续执行。

3. 从道德、情理方面与对方交流，争取对方理解配合：

   • 法律背景：虽然诉讼时效已过，但道德和情理上的考量仍然重要。在某些情况下，对方可能出于道德或情理上的考虑，愿意配合您解决问题。
   • 处理建议：您可以尝试从道德、情理方面与对方进行交流，解释您的困境和诉求，争取对方的理解和配合。若对方愿意，您可以共同寻找其他解决办法，如调解、和解等。

4. 考虑其他法律途径：

   • 法律背景：若行政诉讼途径无法解决问题，您可以考虑其他法律途径，如申请行政复议、提起民事诉讼等。但需要注意的是，不同法律途径的适用条件和程序可能有所不同，您需要仔细了解并选择合适的途径。
   • 处理建议：在考虑其他法律途径前，建议您先咨询专业律师，了解各种途径的适用条件和程序，以及可能面临的法律风险和后果。

在处理此类问题时，您需要注意以下几点：

• 及时行动：一旦发现诉讼时效可能过期，应立即采取行动，避免错过最佳处理时机。
• 保留证据：在处理过程中，应妥善保留相关证据，如诉讼时效中断或中止的证明材料、与对方协商的记录等。
• 咨询专业律师：由于法律问题具有复杂性和专业性，建议您在处理过程中咨询专业律师，以获取更准确、全面的法律建议。

最后，需要强调的是，每个案件的具体情况都有所不同，上述建议仅供参考。若您面临此类问题，建议直接向我咨询，以便根据您的具体情况提供更准确、全面的法律建议。