关于公司统一调整薪资结构后，员工申请劳动仲裁的时效问题，结论前置如下：
一般情况下，员工应在知道或应当知道其权利被侵害之日起一年内申请劳动仲裁。这是根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。若公司统一调整薪资结构，且员工认为此调整侵犯了其合法权益，那么从员工知道或应当知道薪资被调整之日起，一年内应申请劳动仲裁。
若存在劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的情况，仲裁时效可能不受一年限制，但需在劳动关系终止之日起一年内提出。同样依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。若薪资结构调整涉及拖欠或未足额支付劳动报酬，员工在劳动关系存续期间可随时申请仲裁，但若劳动关系已终止，则需在终止之日起一年内提出。
深度分析与法律建议：
时效起算点：员工需明确自己知道或应当知道薪资被调整的具体时间，以此作为仲裁时效的起算点。若公司未正式通知或员工对调整有异议但未及时表达，建议员工保留相关证据，如邮件、短信、工资条等，以证明自己知道或应当知道薪资被调整的时间。
证据收集：在申请劳动仲裁前，员工应尽可能收集与薪资结构调整相关的证据，包括但不限于调整前后的薪资条、劳动合同、公司通知、与HR或上级的沟通记录等。这些证据将有助于证明薪资结构调整的事实以及员工对此的异议。
法律程序：若员工决定申请劳动仲裁，应按照当地劳动仲裁委员会的要求准备申请材料，并按时提交。在仲裁过程中，员工应积极配合仲裁委员会的调查和调解工作，以维护自己的合法权益。
后续行动：若员工对仲裁结果不满，可在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，员工应继续提供证据支持自己的主张，并遵守法院的诉讼程序。
可能的法律后果：
若员工未在时效期内申请劳动仲裁：则可能丧失通过法律途径维护自己合法权益的机会。因此，员工应密切关注仲裁时效，确保在时效期内提出申请。
若员工申请劳动仲裁并获胜诉：则公司需按照仲裁裁决或法院判决支付员工应得的薪资差额及可能的赔偿金。这将有助于维护员工的合法权益，并促进公司依法经营。
总之，面对公司统一调整薪资结构的情况，员工应密切关注自己的仲裁时效，及时收集证据并申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。