职工代表同意但职工不同意的情况，需根据具体事项的性质和法律规定来处理。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、职工代表大会的决策原则
根据《企业民主管理规定》第二十条，职工代表大会选举和表决相关事项，必须按照少数服从多数的原则，经全体职工代表的过半数通过。这意味着，职工代表大会的决策是基于代表们的多数意见作出的。然而，这并不意味着所有职工都必须无条件接受这一决策，特别是当决策涉及到职工个人权益时。
二、职工不同意的情况处理
沟通与协商：
- 当职工代表同意但部分或全体职工不同意时，首先应尝试通过沟通与协商来解决问题。企业可以组织座谈会、听证会等形式，让职工充分表达意见和诉求，同时解释决策的背景和目的，寻求共识。
重新审议或调整决策：
- 如果沟通与协商后，职工仍然持反对意见，且反对意见具有合理性，企业可以考虑重新审议决策或调整决策内容。这有助于平衡企业利益和职工权益，避免决策执行过程中的阻力。
法律途径：
- 如果职工认为职工代表大会的决策侵犯了其合法权益，且无法通过沟通与协商解决，职工可以依法向劳动争议调解组织申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在仲裁过程中，仲裁机构将依据相关法律法规和事实情况作出裁决。
- 特别地，如果决策涉及到劳动合同变更、解除等重大事项，且未经职工本人同意，那么该决策可能因违反法律规定而无效。职工有权要求企业恢复原状或赔偿损失。
三、具体事项的处理建议
劳动合同变更：
- 如果职工代表大会的决策涉及到劳动合同变更（如岗位调整、薪资调整等），且职工不同意，企业应谨慎处理。根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应经双方协商一致。如果无法协商一致，企业不得单方面变更劳动合同。
集体合同签订：
- 如果职工代表大会的决策涉及到集体合同的签订或修改，且职工不同意，那么集体合同可能无法生效或需要重新协商。根据《集体合同规定》，集体合同草案应提交职工代表大会或全体职工讨论通过。如果职工代表或职工持反对意见，集体合同将无法获得通过。
企业规章制度制定：
- 如果职工代表大会的决策涉及到企业规章制度的制定或修改，且职工不同意，企业应考虑规章制度的合理性和合法性。根据《劳动合同法》的相关规定，企业规章制度应经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。如果规章制度违反法律法规或侵犯职工权益，职工有权要求企业修改或废止。
四、法律后果与风险提示
- 决策无效：如果职工代表大会的决策违反法律法规或侵犯职工权益，且未经职工本人同意，那么该决策可能因无效而无法执行。
- 劳动争议：如果职工与企业因职工代表大会的决策产生争议，且无法通过沟通与协商解决，那么可能引发劳动争议。在劳动争议过程中，双方应依法维护自己的权益，避免采取过激行为。
- 法律责任：如果企业因职工代表大会的决策而侵犯职工权益，且未依法承担相应责任，那么可能面临法律责任。这包括赔偿损失、恢复原状等民事责任，以及可能面临的行政处罚或刑事责任。
建议企业在作出涉及职工权益的决策时，应充分听取职工意见，确保决策的合法性和合理性。同时，职工也应积极表达自己的意见和诉求，依法维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。