虚开普通发票100万元，一般情况下应当移交公安机关，但在特定条件下可能暂不移交，需结合具体情节判断。以下从法律定性、移交标准、例外情形三个维度展开分析：

1. 法律定性：虚开发票100万元已达刑事立案标准

根据《刑法》第二百零五条之一及《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》，虚开发票罪的立案追诉标准为：

• 虚开发票金额累计在50万元以上；
• 或虚开发票100份以上且票面金额在30万元以上。

结论：虚开普通发票100万元已远超刑事立案门槛，原则上属于公安机关管辖的刑事案件，税务机关发现后应当移交公安机关立案侦查。

2. 移交标准：税务机关的法定职责

根据《税收征收管理法》第七十七条及《行政执法机关移送涉嫌犯罪案件的规定》，税务机关在查处税收违法行为时，发现涉嫌犯罪的，必须依法移送公安机关，不得以行政处罚代替刑事处罚。具体流程包括：

• 税务机关内部审核后制作《涉嫌犯罪案件移送书》；
• 连同证据材料在24小时内移送公安机关；
• 公安机关需在3日内作出是否立案的决定。

例外情形：若案件存在证据不足、情节显著轻微等情形，税务机关可暂不移交，但需补充调查或依法作出行政处罚。

3. 暂不移交的例外情形（需严格审查）

实践中，以下情况可能暂不移交，但需满足严格条件：

• 情节显著轻微：如虚开发票未造成税款损失，且行为人主动补缴税款、缴纳罚款；
• 证据不足：税务机关无法证明行为人主观故意（如被利用为“过账”工具）；
• 程序瑕疵：税务机关未完成行政处罚程序（如未下达《税务处理决定书》）。

风险提示：即使暂不移交，若后续补充证据或公安机关独立发现线索，仍可能启动刑事程序。行为人不可因暂未移交而放松警惕。

实务建议

1. 立即自查：核实发票流向、资金回流等关键证据，评估主观故意程度；
2. 主动补救：若存在税款损失，尽快补缴税款、滞纳金及罚款；
3. 法律应对：委托律师介入，与税务机关、公安机关沟通，争取从宽处理。

提示：虚开发票案件的刑事风险极高，切勿抱有侥幸心理。如有具体案件细节，可直接向我咨询，我将结合证据材料提供定制化法律方案。