结论是：公司上12天休18天但只发12天工资的行为，是否违法需根据具体情况判断，但多数情况下可能违法。
一、从劳动法关于工作时间和工资支付的规定分析
根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者有获得劳动报酬的权利，且工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。同时，劳动法也规定了劳动者的工作时间和休息休假权利。
如果这12天的工作时间符合法定工作时间：
- 例如，每天工作不超过8小时，每周工作不超过44小时（或根据最新规定调整的工作时间），且公司已经按照实际工作天数支付了工资，那么从表面上看，公司并未直接违反劳动法关于工资支付的规定。但关键在于，这种排班方式是否合理，以及是否影响了劳动者的休息休假权利。如果12天的工作导致劳动者无法享受正常的休息日，且公司未给予相应的调休或补偿，则可能构成对劳动者休息休假权利的侵犯。
如果这12天的工作时间超出了法定工作时间：
- 例如，每天工作超过8小时，或者虽然每天工作不超过8小时但总工作时间超过了法定周工作时间，那么公司应当支付加班费。如果公司只按照正常工作天数支付了工资，而未支付加班费，则明显违反了劳动法关于加班工资支付的规定。
二、从劳动合同和公司规章制度的角度分析
劳动合同的约定：
- 如果劳动合同中明确约定了劳动者的工作时间、休息休假和工资支付方式，且公司的排班和工资支付方式符合劳动合同的约定，那么从合同法的角度来看，公司并未违约。但同样，如果这种排班方式影响了劳动者的休息休假权利，且劳动合同中未对此进行合理约定或补偿，则劳动者可能主张合同条款显失公平或违反法律强制性规定。
公司规章制度的规定：
- 如果公司规章制度中规定了劳动者的工作时间、休息休假和工资支付方式，且这些规定不违反法律强制性规定，那么公司应当按照规章制度执行。但如果规章制度本身存在违法或不合理之处，或者公司未按照规章制度执行，则可能构成对劳动者权益的侵犯。
三、建议与风险提示
核实工作时间和工资支付情况：
- 劳动者应当核实自己的实际工作时间和公司支付的工资是否符合劳动法规定和劳动合同约定。如果发现公司存在违法行为或违约行为，应当及时与公司沟通或向劳动监察部门投诉。
保留相关证据：
- 劳动者应当保留与工作时间、工资支付相关的证据，如考勤记录、工资条、劳动合同等。这些证据在后续维权过程中将起到关键作用。
寻求法律帮助：
- 如果劳动者与公司无法就工作时间和工资支付问题达成一致，或者认为公司存在违法行为或违约行为，可以寻求法律帮助。作为专业律师，我可以为劳动者提供法律咨询和代理服务，帮助劳动者维护自己的合法权益。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。