结论前置：员工在工伤后已提交辞职单但公司总经理不签字，可通过以下方式处理：

1. 明确辞职的法律效力
   根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前30日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同（试用期提前3日）。辞职权是劳动者的单方权利，无需用人单位批准。因此，即使总经理未签字，只要员工能证明已提交书面辞职申请（如通过邮件、快递、签字确认单等），30日期满后劳动关系即依法解除。

2. 处理总经理不签字的操作建议

   • 留存提交证据：通过EMS邮寄辞职信（备注文件名称）、微信/邮件发送辞职通知并保留记录，或让同事见证提交过程并签字确认。
     
   • 书面催告公司：若公司拖延，可向公司发送《催告函》，明确要求限期办理离职手续，否则将通过法律途径解决。
     
   • 申请劳动仲裁：若公司拒不办理离职手续（如不出具离职证明、扣押档案等），可向劳动仲裁委申请仲裁，要求确认劳动关系已解除并责令公司配合办理手续。

3. 工伤期间的特殊保护
   若员工仍处于医疗期（根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》），用人单位不得以“总经理不签字”为由阻止辞职，但员工需注意：

   • 工伤医疗期内辞职，可能影响一次性伤残就业补助金的领取（需根据地方规定判断）；
     
   • 建议优先完成工伤认定和劳动能力鉴定，再办理离职，以确保工伤待遇不受损。

4. 公司可能存在的违法点
   若公司以“不签字”为由拒付工资、扣押证件或拒绝出具离职证明，可能涉及以下违法：

   • 违反《劳动合同法》第五十条（未出具离职证明需赔偿损失）；
     
   • 违反《工资支付暂行规定》第九条（离职时需一次性结清工资）。
     员工可据此主张赔偿。

行动建议：

• 立即整理辞职申请的提交证据；
  
• 向公司发送书面催告函；
  
• 若公司仍不配合，携带证据向劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。
  

如有进一步细节（如是否完成工伤认定、公司具体拖延行为等），可直接向我咨询，我会结合具体情形提供针对性方案。