公司员工手册中规定休6个月病假底薪50元，这一规定是否合理，需要从多个角度进行分析：
从法律法规的角度来看：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。在医疗期内，企业不得解除劳动合同，且应按照规定支付病假工资或疾病救济费。
- 病假工资或疾病救济费的支付标准，通常应不低于当地最低工资标准的80%。若公司规定的病假底薪50元远低于这一标准，则可能违反法律法规。
从合同约定的角度来看：
- 员工手册作为公司内部规章制度，其内容应与劳动合同相一致，且不得违反法律法规的强制性规定。
- 如果劳动合同中明确规定了病假期间的工资待遇，且该待遇高于员工手册中的规定，则应以劳动合同为准。
- 如果员工手册中的规定未经员工同意或未通过民主程序制定，且对员工权益产生不利影响，该规定可能不具备法律效力。
从公平合理的角度来看：
- 病假期间，员工因健康原因无法正常工作，其经济来源可能受到影响。因此，病假工资应能够保障员工的基本生活需求。
- 底薪50元显然无法满足员工的基本生活需求，尤其是在长期病假的情况下。这样的规定可能缺乏公平性和合理性。
建议与后果：
- 建议：公司应重新审视并调整员工手册中关于病假工资的规定，确保其符合法律法规的要求，并体现对员工的关怀和尊重。同时，公司应与员工进行充分沟通，确保员工手册的内容得到员工的认可和遵守。
- 可能的法律后果：如果公司坚持执行不合理的病假工资规定，可能面临劳动争议和法律纠纷。员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司支付合理的病假工资并承担相应的法律责任。
总结：公司员工手册中规定休6个月病假底薪50元，这一规定在法律法规、合同约定以及公平合理等方面都存在明显的问题。公司应尽快调整这一规定，以维护员工的合法权益和公司的良好形象。如果您对此有进一步的疑问或需要法律帮助，请随时向我咨询。