核心结论：化妆品店被监管部门查到牙膏违规时，具体处理方式和罚款金额需结合违规类型、情节严重性及当地法规综合判断，以下分情况说明：
1. 牙膏属于化妆品监管范围时的处理
- 法律依据：根据《化妆品监督管理条例》，牙膏若被纳入化妆品定义（如宣称具有清洁、美化、修饰等功效），则需遵守化妆品监管规则。
- 常见违规情形及处罚：
- 未备案/未注册：若牙膏未按规定备案或注册，监管部门可责令改正，处1万元以上3万元以下罚款；拒不改正的，处3万元以上5万元以下罚款。
- 标签违规：如标签未标注全成分、警示语，或虚假标注功效，可处违法所得3倍以下罚款（最高不超过3万元）；无违法所得的，处1万元以下罚款。
- 经营不合格产品：若牙膏经检验不符合强制性标准，没收违法所得及产品，并处违法所得3-5倍罚款（最低5万元起）；情节严重的，责令停业整顿直至吊销许可证。
2. 牙膏属于普通日用品时的处理
- 法律依据：若牙膏未宣称功效，仅作为清洁用品，则可能适用《产品质量法》或《消费者权益保护法》。
- 常见违规情形及处罚：
- 以次充好/掺杂掺假：没收违法所得，并处违法所得1-5倍罚款；无违法所得的，处1万元以下罚款。
- 虚假宣传：如宣传“美白”“防蛀”等功效但无依据，可处广告费用3-5倍罚款（最低20万元起）；情节严重的，吊销营业执照。
3. 特殊情形：进口牙膏违规
- 未办理进口手续：若进口牙膏未取得《进口非特殊用途化妆品备案凭证》或《进口特殊用途化妆品行政许可批件》，可处货值金额3-10倍罚款（最低5万元起）；情节严重的，责令停业整顿。
- 标签不符合中文要求：进口产品需标注中文标签，未标注的可处5000元以上3万元以下罚款。
关键建议：
- 立即整改：收到监管通知后，应第一时间下架违规产品，停止相关宣传，并配合调查。
- 证据留存：保存进货凭证、产品检测报告等材料，证明自身无主观故意。
- 协商处理：若对处罚有异议，可在收到决定书后60日内申请行政复议，或6个月内提起行政诉讼。
提示：具体处罚需结合地方实施细则，建议提供牙膏标签照片、进货单据等材料，以便进一步分析。如有疑问，可直接向我咨询。