退役士兵自谋职业协议程序违法领的钱，一般情况下是需要退还的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律原则角度
根据法律原则，任何通过违法程序获取的利益都是不受法律保护的。退役士兵自谋职业协议程序如果违法，那么基于该违法程序所领取的款项，就属于不当得利。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不当得利应当返还给受损方。因此，从法律原则的角度来看，违法领取的钱款是需要退还的。
二、具体法律条款角度
虽然直接针对退役士兵自谋职业协议程序违法的法律条款可能并不明确，但我们可以从相关法律法规中推导出相应的法律后果。例如，如果自谋职业协议的签订过程中存在欺诈、胁迫等违法行为，那么该协议可能被认定为无效。根据《中华人民共和国民法典》关于合同无效的规定，因无效合同取得的财产，应当予以返还。因此，在这种情况下，违法领取的钱款同样需要退还。
三、实际操作与后果角度
行政处理：如果退役士兵自谋职业协议程序违法，相关部门可能会进行行政调查，并要求违法领取钱款的人员进行退还。如果拒不退还，可能会面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
民事诉讼：如果违法领取钱款的行为给其他方造成了损失，受损方可能会通过民事诉讼的方式要求退还钱款，并可能要求赔偿损失。在民事诉讼中，法院会根据事实和法律规定，判决违法领取钱款的人员进行退还，并可能承担诉讼费用等额外负担。
刑事责任：在极端情况下，如果违法领取钱款的行为构成了犯罪，如诈骗罪等，那么违法人员可能会面临刑事责任，包括有期徒刑、罚金等。
四、建议与措施
主动退还：如果您意识到自己通过违法程序领取了钱款，建议您主动退还，以避免可能的法律后果。
咨询专业意见：如果您对自谋职业协议的程序是否违法存在疑问，或者对退还钱款的具体操作有困惑，建议您咨询专业的法律人士，如我，汪婷婷律师，以获取更具体的法律建议。
配合调查：如果相关部门对自谋职业协议程序违法进行调查，建议您积极配合，提供必要的证据和信息，以加快调查进程并减少可能的法律后果。
综上所述，退役士兵自谋职业协议程序违法领的钱，一般情况下是需要退还的。这不仅符合法律原则和相关规定，也是避免可能法律后果的最佳选择。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。