员工自行离职后声称公司拖欠工资，且其突然离职给公司造成损失的，公司损失的计算及应对方式需分情况讨论：
一、员工自行离职与拖欠工资的法律定性
员工自行离职：
- 根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。若员工未履行通知义务即擅自离职，可能构成违法解除劳动合同，需承担相应责任。
- 但若公司存在未及时足额支付劳动报酬等违法行为，员工可依据《劳动合同法》第三十八条立即解除劳动合同，且无需提前通知。
公司拖欠工资：
- 根据《劳动合同法》第三十八条及第四十六条，用人单位未及时足额支付劳动报酬的，劳动者有权解除劳动合同，并要求用人单位支付经济补偿。
- 经济补偿的计算方式为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。
- 若劳动行政部门责令公司限期支付劳动报酬而公司逾期不支付，公司还需按应付金额的百分之五十以上百分之一百以下的标准加付赔偿金。
二、公司因员工突然离职造成损失的计算
直接损失：
- 包括因员工离职导致的生产停滞、客户流失、项目延误等直接经济损失。
- 计算方式：根据实际损失情况，如合同违约赔偿、额外招聘费用、临时用工成本等，进行具体核算。
间接损失：
- 包括因员工离职对公司声誉、客户关系等造成的长期负面影响。
- 间接损失通常难以量化，但可通过市场调研、客户反馈等方式进行评估。
举证责任：
- 公司需承担举证责任，证明员工离职与损失之间的因果关系及损失的具体数额。
- 建议公司保留相关证据，如员工离职通知、工作交接记录、损失计算依据等。
三、公司应对策略
协商解决：
- 公司可与员工协商，就工资支付、损失赔偿等问题达成一致。
- 协商过程中，公司应明确表达立场，同时保持理性，避免情绪化冲突。
法律途径：
- 若协商无果，公司可向劳动监察部门投诉员工违法解除劳动合同的行为。
- 同时，公司可就拖欠工资问题向劳动仲裁机构申请仲裁，要求员工承担相应责任（若员工存在过错）。
- 若员工主张拖欠工资，公司需准备充分证据反驳，如工资发放记录、员工签字确认的工资单等。
完善内部管理：
- 公司应完善劳动合同、规章制度等内部管理文件，明确员工离职流程、违约责任等条款。
- 加强员工培训，提高员工法律意识，减少因员工违法解除劳动合同给公司造成的损失。
四、具体案例与法律建议
- 案例：某员工因公司拖欠工资而自行离职，但未提前通知公司。公司因此遭受生产停滞损失。后员工主张公司拖欠工资，要求支付经济补偿。
- 法律建议：
- 公司应首先核实是否拖欠员工工资。若确实存在拖欠，应尽快补发，并考虑是否需支付经济补偿及加付赔偿金。
- 若员工未提前通知即离职，给公司造成损失，公司可要求员工赔偿。但需注意，赔偿范围应限于直接经济损失，且需公司举证证明。
- 建议公司在此类纠纷中保持冷静，通过法律途径维护自身权益，避免与员工发生直接冲突。
如有进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。