公司要求员工换公司主体，并让员工签离职申请后签新公司合同，这一行为对公司而言，可能涉及以下几个方面的法律问题和后果：

1. 劳动合同变更的合法性：

   • 合法变更情形：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。若公司能够与员工就变更劳动合同主体（即从原公司变更为新公司）达成一致，并签订书面变更协议，则此行为在法律上是允许的。但关键在于，这种变更必须基于双方的自愿和协商一致，且不得损害员工的合法权益。
   • 违法变更后果：若公司未经员工同意，单方面要求员工签离职申请并签新公司合同，这可能构成违法解除劳动合同或未按照劳动合同约定提供劳动条件。员工有权拒绝，并可能要求公司继续履行原劳动合同或支付经济补偿金。

2. 经济补偿金的支付义务：

   • 合法解除情形下的补偿：如果公司因经营需要或其他合法原因，确实需要与员工解除原劳动合同，并协商一致变更至新公司，那么在解除原劳动合同时，公司应依法支付员工经济补偿金（除非双方另有约定且该约定不违反法律法规）。
   • 违法解除情形下的赔偿：若公司未经合法程序单方面解除劳动合同，员工有权要求公司支付赔偿金，赔偿金的标准通常为经济补偿金的两倍。

3. 社保和公积金的连续缴纳：

   • 社保和公积金的转移：在变更劳动合同主体时，公司应确保员工的社保和公积金账户能够顺利转移至新公司，并保持连续缴纳，以避免影响员工的社保权益和公积金贷款等。
   • 未连续缴纳的后果：若因公司原因导致员工社保和公积金中断缴纳，员工可能面临无法享受社保待遇、公积金贷款受限等风险，公司也可能因此承担法律责任。

4. 员工权益的保护：

   • 员工知情权：公司有义务向员工充分说明变更劳动合同主体的原因、后果及影响，确保员工在充分知情的情况下做出决定。
   • 员工选择权：员工有权选择是否接受变更，公司不得强迫或威胁员工接受。若员工拒绝变更，公司应依法处理与员工的劳动关系。

针对公司的建议：

• 在变更劳动合同主体前，应与员工进行充分沟通，确保双方就变更事宜达成一致。
• 签订书面变更协议，明确变更后的权利义务关系，避免后续纠纷。
• 依法支付经济补偿金（如适用），并确保员工的社保和公积金账户能够顺利转移并连续缴纳。
• 尊重员工的知情权和选择权，不得强迫或威胁员工接受变更。

若公司未遵循上述建议，可能面临的法律后果包括但不限于：被要求继续履行原劳动合同、支付经济补偿金或赔偿金、承担社保和公积金中断缴纳的法律责任等。因此，公司在处理此类事宜时，应谨慎行事，确保合法合规。