结论：在一般情况下，辞职交接时扣除绩效工资是不合法的，但特定情况下，如劳动合同或规章制度有明确约定，或员工存在违规行为，公司可能有权扣除部分绩效工资。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据与基本原则
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条明确规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。绩效工资作为工资的组成部分，同样受到法律保护。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第六十二条也指出，用工单位应当支付加班费、绩效奖金等福利待遇，进一步确认了绩效奖金是劳动者的合法权益。
二、不合法的情况分析
无明确约定或规定：
- 如果劳动合同及公司规章制度中均未提及离职时可扣除绩效工资，那么公司扣除员工绩效工资的行为缺乏依据，属于不合法行为。
- 举例：员工按公司规定提前提交离职申请并完成所有交接手续，但公司无故扣除其绩效工资，且合同和规章中均无相关条款，此情况公司做法不合法。
绩效考核达标且完成工作任务：
- 员工离职前已完成工作任务并达到绩效要求，公司应支付绩效工资，不能无故扣除。
- 举例：员工离职前销售业绩达标，工作顺利完成，但公司却扣除其绩效工资，此行为不合理且不合法。
三、可能合法的情况分析
有明确约定或规定：
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了在某些特定情形下，员工正常离职时公司可以扣除绩效工资，并且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照约定执行是合法的。
- 举例：公司规章制度中规定，员工离职时若未能完成正在进行的重要项目且对公司业绩有重大影响，公司有权扣除部分绩效工资。员工入职时已知晓并同意该规定，那么在符合规定情形时，公司扣除绩效工资是合法的。
员工存在违反公司规定的行为：
- 如果员工在离职前存在违反公司规章制度、工作纪律等行为，对公司造成了损失，公司根据相关规定和损失情况，扣除部分绩效工资作为处罚是合法的。
- 举例：员工离职前故意泄露公司商业机密，给公司带来经济损失，公司根据规章制度和相关法律规定扣除其部分绩效工资，此做法合法。
四、劳动者权益保护途径
- 向劳动行政部门投诉：如果用人单位存在克扣绩效工资的行为，劳动者可以向劳动行政部门投诉，要求其调查处理并纠正违法行为，同时支付被克扣的工资及相应的赔偿金。
- 劳动仲裁：劳动者也可以通过劳动仲裁的方式维护自己的合法权益。在劳动仲裁过程中，劳动者需要提供相关证据（如劳动合同、绩效工资计算依据等）以证明用人单位存在克扣绩效工资的行为。劳动仲裁机构会根据法律规定和证据情况作出公正裁决。
五、建议与总结
- 建议：用人单位在制定劳动合同和规章制度时，应明确绩效工资的考核与发放标准，避免引发不必要的纠纷。同时，劳动者也应了解自己的权利与义务，在遭遇不公时积极寻求法律途径维护自身权益。
- 总结：辞职交接时扣除绩效工资是否合法，需根据具体情况判断。在大多数情况下，这种行为是不合法的。但如果有明确的劳动合同或规章制度约定，或者员工存在违规行为，公司可能有权扣除部分绩效工资。
如果您在辞职交接过程中遇到公司扣除绩效工资的情况，且认为这种行为不合法，可以向我咨询具体的法律维权途径。