结论前置：若公司对员工违纪行为作出罚款5000元决定且员工不接受，员工可通过正式书面函件向公司表达异议，函件需明确异议理由、法律依据及诉求。以下为具体分析及函件撰写建议：

一、法律分析：公司罚款的合法性边界

1. 法律依据
   根据《劳动合同法》第三十八条及《工资支付暂行规定》第十六条，公司对员工罚款需满足以下条件：
   
   • 罚款需基于合法有效的规章制度（如员工手册经民主程序制定并公示）；
     
   • 罚款金额不得超过员工当月工资的20%（且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准）；
     
   • 罚款事由需与员工直接相关且符合公平原则（如因员工重大过失导致公司损失）。
     

若公司罚款5000元违反上述任一条件（如规章制度未公示、罚款超比例、事由不成立），员工有权拒绝接受。

1. 常见违法情形
   
   • 规章制度未通过民主程序（如未召开职工代表大会讨论）；
     
   • 罚款金额过高（如员工月薪1万元，罚款5000元即达50%，远超20%上限）；
     
   • 罚款事由模糊（如“工作态度不端正”等主观评价，无客观标准）。

二、函件撰写要点：明确异议、有理有据

员工发函需包含以下核心内容，以增强说服力并保留证据：

1. 函件标题
   建议使用《关于对[公司名称]违纪处罚决定的异议函》，明确函件性质。

2. 正文结构

   • 首段：简述事实（如“本人于[日期]收到公司《违纪处罚通知书》，决定对本人罚款5000元”）；
     
   • 异议理由：
     
     • 指出公司罚款的违法点（如“规章制度未公示，对本人无约束力”）；
       
     • 引用具体法律条款（如“根据《工资支付暂行规定》第十六条，罚款不得超过月工资20%”）；
       
     • 说明罚款对个人生活的影响（如“罚款5000元导致本人当月工资低于最低工资标准”）。
       
   • 诉求：明确要求公司撤销罚款决定或调整罚款金额（如“请公司于[日期]前撤销罚款决定，否则将通过法律途径维权”）。

3. 证据附注
   附上相关证据（如工资条、规章制度文本、处罚通知书复印件），增强函件可信度。

三、函件示例（模板）

关于对[公司名称]违纪处罚决定的异议函

[公司名称]：

本人[姓名]，于[日期]收到公司《违纪处罚通知书》，决定对本人罚款5000元。现就该决定提出如下异议：

1. 公司罚款缺乏合法依据
   根据《劳动合同法》第四条，公司规章制度需经职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表协商确定。本人未参与相关讨论，亦未见到规章制度公示文件，故该制度对本人无约束力。

2. 罚款金额违反法律规定
   本人月工资为[金额]元，5000元罚款占月工资的[比例]%，远超《工资支付暂行规定》第十六条规定的20%上限。此外，扣除罚款后本人当月工资将低于[当地最低工资标准]元，违反法律规定。

3. 处罚事由不成立
   通知书载明的“[具体违纪事由]”缺乏客观证据支持，属于主观评价，不符合公平原则。

诉求：请公司于[日期]前撤销罚款决定，并书面回复处理结果。否则，本人将依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

附：1. 工资条复印件；2. 处罚通知书复印件。

异议人：[姓名]
日期：[年月日]

四、后续建议

1. 保留证据：发函前复印所有相关材料，函件通过EMS邮寄并留存签收记录；
   
2. 协商优先：若公司态度缓和，可协商调整罚款金额或以其他方式（如警告、培训）替代；
   
3. 法律途径：若公司拒绝撤销，可向当地劳动监察大队投诉（时效2年）或申请劳动仲裁（需在知道权利被侵害之日起1年内提出）。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供详细方案。