电子申请离职后，拿回工资通常不会受到影响，但具体情形需结合实际情况分析。以下是从不同角度为你进行的详细分析：
一、电子申请离职的法律效力
电子申请离职，只要符合法律规定的要件，即具有法律效力。根据《劳动合同法》的相关规定，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。这里的“书面形式”并不局限于纸质文件，电子形式（如电子邮件、内部办公系统等）在符合一定条件下，也可以视为书面形式。因此，如果你通过电子方式提交了离职申请，并且该申请已经有效送达用人单位，那么你的离职行为就是合法的。
二、工资支付的法律义务
用人单位在劳动者离职时，有义务支付其应得的工资。这包括基本工资、奖金、津贴等所有劳动报酬。无论劳动者是通过何种方式提出离职，用人单位都不得因此克扣或拖欠工资。如果用人单位在劳动者离职后拒绝支付工资，劳动者有权通过劳动仲裁等法律途径维护自己的合法权益。
三、可能影响工资支付的情况
虽然电子申请离职本身不会影响工资的支付，但在某些特殊情况下，工资的支付可能会受到一定影响：
未提前通知或通知期不足：如果劳动者未按照法律规定提前三十日通知用人单位就擅自离职，可能会给用人单位造成损失。在这种情况下，用人单位有权要求劳动者赔偿损失，但这并不意味着用人单位可以因此克扣工资。用人单位只能从应支付的工资中扣除相应的赔偿金额，且扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
存在未了结的财务或业务问题：如果劳动者在离职时存在未了结的财务或业务问题（如未归还公司财物、未完成工作交接等），用人单位可能会暂时扣留工资作为担保。然而，这种做法并不合法。用人单位应当通过合法途径解决这些问题，而不是扣留劳动者的工资。
劳动合同中有特殊约定：如果劳动合同中有关于离职后工资支付的特殊约定（如需要完成一定的工作交接后才能支付工资等），那么工资的支付可能会受到这些约定的影响。但需要注意的是，这些约定必须合法且合理，不能违反法律法规的强制性规定。
四、建议与措施
保留证据：在提交电子离职申请时，建议保留好相关的证据（如电子邮件截图、内部办公系统记录等），以证明你已经按照法律规定提出了离职申请。
及时沟通：在离职过程中，与用人单位保持及时沟通，确保工作交接的顺利进行，并了解工资支付的具体情况。
依法维权：如果用人单位在离职后拒绝支付工资或存在其他违法行为，你可以依法向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议。